آنالیر عوامل رونویسی و پیش بینی مولفه های ساختاری ژن های سازنده آنزیم امگا 6 فتی اسید دی سچوراز
- سال انتشار: 1391
- محل انتشار: سومین همایش ملی بیوتکنولوژی کشاورزی ایران (گیاهی، دامی و صنعتی)
- کد COI اختصاصی: AGRIBIOTECH03_080
- زبان مقاله: فارسی
- تعداد مشاهده: 1229
نویسندگان
کارشناس زیست شناسی دانشگاه پیام نور
دانشجوی کارشناسی زیست شناسی دانشگاه پیام نور قم
کارشناس زیست شناسی دانشگاه پیام نور قم
گروه پژوهشی بیوانفورماتیک، پژوهشکده سبز دانشگاه قم
چکیده
آنزیم امگا 6 فتی اسید ، آنزیمی دی سچوراز و غیر اشباع کننده است که باعث اضافه شدن دومین پیوند دوگانه به زنجیره اسید چرب 20 کربنه ی امگا 3 و امگا 6 می شود. مهمترین ماتریکس ها و خانواده های فاکتورهای رونویسی توسط ابزار های بیوانفورماتیکی که در رونویسی ژن Omega-6 Fatty Acid Desaturase FAD6 نقش دارند نیز تعیین شد . و فاکتورهای رونویسی جهت پیدا کردن کاندیدی احتمالی که تا به حال در مقاله ای ثبت نشده باشد جستجو شد. با استفاده از ابزارهای مدل سازی و برنامه های مختلف داده کاوی نسبت به طراحی بانک اطلاعاتی از متغیرهای ژنی حدود 110 فستای ژنی آنزیمهای فوق در گونه های مختلف اقدام شده و سپس با استفاده از مدلهای وزن دهی، درخت های تصمیم گیری و روشهای دسته بندی نسبت به شناسایی مهمترین متغیرها اقدام شد. در نهایت برای اولین بار طراحی مدل های پیش بینی نوع ارگانیزم بر اساس متغیرهای ژنی انجام شد.سپس با استفاده از دیتا بیس های ژنی تحت وب ، حدود 110 ژنی که سازنده ی آنزیم استریول کو آنزیم آ در تمام موجودات است ، جمع آوری شد و با استفاده از مدل های پیش بینی وب سایت های ژنتیکی ، فاکتورهای رونویسی که بیشترین شباهت را با پروموتر ژن های سازنده ی این آنزیم داشتند پیش بینی شدند و بر اساس نوع ماتریکس و خانواده ی فاکتور های رونویسی دسته بندی شدند مهمترین متغیر ژنی در تشخیص ساختارهای ارگانیزمی آنزیم FAD6 مولفه ی تعداد نوکلئوتید های گوانین و تیمین که به ترتیب به هم متصل اند GT بوده است. همچنین مدلهای پیش بینی طراحی شده نشان دادند که مدل شبکه ی عصبی Neural Net با دقت 97.75% می تواند ارگانیزم آنزیمهای جدید را بر اساس خصوصیات ژنی پیش بینی نماید.کلیدواژه ها
Omega-6 Fatty Acid Desaturase ، امگا 6 فتی اسید دی سچوراز ، FAD6 ، . امگا 3 و امگامقالات مرتبط جدید
- بررسی تنوع زیستی گیاهان مرتعی ارتفاعات کبیرکوه در جنوب دره شهر (استان ایلام)
- عوامل موثر بر میزان پیچان رودخانه های خرم اباد
- ارزیابی کیفیت آب شرب گاوهای شیری در گاوداری های صنعتی حومه مشهد از نظر وجود فلزات سنگین، نیترات و سولفات
- بیو پلیمر پلی ساکاریدی برای مصارف دامپزشکی
- راهکارهای کارآمد کاهش انتشار گازهای گلخانه ای از طریق فناوری کشاورزی هوشمند
اطلاعات بیشتر در مورد COI
COI مخفف عبارت CIVILICA Object Identifier به معنی شناسه سیویلیکا برای اسناد است. COI کدی است که مطابق محل انتشار، به مقالات کنفرانسها و ژورنالهای داخل کشور به هنگام نمایه سازی بر روی پایگاه استنادی سیویلیکا اختصاص می یابد.
کد COI به مفهوم کد ملی اسناد نمایه شده در سیویلیکا است و کدی یکتا و ثابت است و به همین دلیل همواره قابلیت استناد و پیگیری دارد.