شبکه تنظیم بیان ژنهای چرخه سلولی ساکارومیسس سرویسیه به روش همبستگی وزنی

سال انتشار: 1391
نوع سند: مقاله کنفرانسی
زبان: فارسی
مشاهده: 700

متن کامل این مقاله منتشر نشده است و فقط به صورت چکیده یا چکیده مبسوط در پایگاه موجود می باشد.
توضیح: معمولا کلیه مقالاتی که کمتر از ۵ صفحه باشند در پایگاه سیویلیکا اصل مقاله (فول تکست) محسوب نمی شوند و فقط کاربران عضو بدون کسر اعتبار می توانند فایل آنها را دریافت نمایند.

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این مقاله:

شناسه ملی سند علمی:

AGRIBIOTECH03_075

تاریخ نمایه سازی: 27 تیر 1392

چکیده مقاله:

شبکه های ژنی یکی از روشهای موثر برای درک بهنر روابط و تعاملات تنظیمی میان ژنهاست. روشهای مختلفی برای ترسیم شبکه وجود دارد. از روی همبستگی پیرسون بین داده های بیان ژن اخذ شده از پروژه انالیز چرخه سلولی مخمر ساکارومیسس سرویسیه در دانشگاه استانفورد ، محاسبه ماتریس همبستگی ، ماتریس همجواری ، ماتریس عدم شباهت ناشی از همپوشانی توپولوژیکی تعمیم یافته و نهایتا خوشه بندی برای 1000 ژنی 03/05/2013ه بیشترین ارتباط را با هم نشان دادند انجام شد. برای این منظور بسته در محیط نرم افزار R فراخوانده شد. نتایج حاصل از این آنالیز اطلاعات مفیدی از تعاملات میان ژنهای مذکور از جمله شناسایی ژنهای کلیدی و نیز شناسایی مسیرهای مهم در چرخه سلولی این مخمر که در مهندسی مسیر مورد استفاده واقع خواهند شد فراهم نمود. خوشه بندی ژنهای مذکور با کارکرد بیولوژیکی ژنهای مشابه در هر خوشه منطبق بود.

نویسندگان

محمد حسین بناءبازی

گروه علوم دامی - دانشکده علوم و مهندسی کشاورزی - پردیس کشاورزی و منابع ط

معصومه ناصرخلیل

گروه علوم دامی - دانشکده علوم و مهندسی کشاورزی - پردیس کشاورزی و منابع ط

رضا میرایی آشتیانی

گروه علوم دامی - دانشکده علوم و مهندسی کشاورزی - پردیس کشاورزی و منابع ط

مراجع و منابع این مقاله:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :
  • Costanzo et al., (2010) The Genetic Landscape of a Cell. ...
  • Langfelder, P., Horvath, S. (2008) WGCNA: an R package for ...
  • Carlson MRJ, Zhang B, Fang Z, Mischel PS, Horvath S, ...
  • Batagelj, V., Mrvar, A. Pajek - Analysis and Visualization of ...
  • Spellman, PT., Sherlock, G., Zhang, MQ., Iyer, VR., Anders, K., ...
  • Yip A, Horvath S (2006) The Generalized Topological Overlap Matrix ...
  • نمایش کامل مراجع