الگوریتن شناسایی ژنهای متفاوت بیاى شذه در داده های حاصل از ریزآرایه مخمر ساکاروهیسس سرویسیه با استفاده از بسته های نرم افزاری R

با استفاده از بسته های نرم افزاری R بویژه Limma و با استفاده از اطلاعاتروژه آنالیز چرخه سلولی مخمر ساکارومیسس سرویسیه در دانشگاه استانفورد زنهای متفاوت بیان شده برای پنج مرحله اصلی جرخه سلولی این مخمر شامل مراحل تقسیم میتوز و رشد شناسایی گردید. این داده ها از میزان بان ژنهای موجود بر روی ریزارایه های مربوطه در فواصل زمانی مختلف و در قالب 5 ازمایش بدست امد . تفاوت در بیان زنها بر ارزش یک مدل خطی بر روی دادههای بیان ژن و از روی برآردهای بیزی حاصل ار آن بدست امد. آنالیز واریانس مدل تابعیت خطی بر ارزش شده برای بیان ژنهای مخمر در زوا زمانهای مختلف و بازاء هر یک از مراحل اصلی چرخه سلولی و با مقایسه با بیان ژنهای شاهد تعبیه شده بدست آمد. در مجموع اطلاعات مربوط به 4000 قابل انالیز بود که از این میان 800 ژن بر تنظیم چرخه سلولی موثر تشخیص داده شده و بیان متقاوتی داشتند . در مجموع این تحقیق یکبار دیگر کارایی مدلهای خطی و برآوردهای بیزی اشنا برای اکثر متخصصین اصلاح نژاد دام به منظور آنالیز داده های بیان ژن نیز نشان داد. این داده ها می تواند اصلاحگران دام را در شناسایی زنهای موثر بر صفات مورد نظرشان یاری نماید . این مطالعه نمونه ای از کاربردهای بیوانفورماتیک و سامانه های زیستی محاسباتی را در مطالعات تنظیم بیان ژن نشان داد.

کلیدواژه ها:

ریز ارایه های بیاان ژن ، ژنهای متفاوت بیان شده ، نرم افزار R ، بسته Limma ، مخمر ساکارومیسس سرویسیه ، چرخه سلولی