مقایسه تداوم صحت ارزشهای اصلاحی ژنومی بهترین پیشبینی نااریب خطی کروموزومی با برخی روشهای مرسوم در انتخاب ژنومی
- سال انتشار: 1391
- محل انتشار: سومین همایش ملی بیوتکنولوژی کشاورزی ایران (گیاهی، دامی و صنعتی)
- کد COI اختصاصی: AGRIBIOTECH03_073
- زبان مقاله: فارسی
- تعداد مشاهده: 1057
نویسندگان
دانشجوی دکتری-ردیس کشاورزی و منابع طبیعی دانشگاه تهران
دانشیار پردیس کشاورزی و منابع طبیعی دانشگاه تهران
استاد پردیس کشاورزی و منابع طبیعی دانشگاه تهران
استادیار پردیس کشاورزی و منابع طبیعی دانشگاه تهران
چکیده
تداوم صحت (ضریب تابعیت صحت بر روی نسل) ارزیابیهای ژنومی از این دیدگاه دارای اهمیت است که مشخص میکند پس از چند نسل نیاز به دوباره برآورد اثر نشانگرها است، چون این امر نیاز به جمعآوری رکوردهای فنوتیپی داشته و در نتیجه هزینهبر است. هدف از این تحقیق مقایسه تداوم صحت ارزشهای اصلاحی ژنومی پیشبینی شده با روش بهترین پیشبینی نااریب خطی کروموزومی Chromosomal Best Linear Unbiased Prediction (ChrBLUP) با روشهای BLUP و بیزی در ارزیابی ژنومی بود. جهت این امر تعداد کروموزومها و نشانگرها به ترتیب 10 و 10000 عدد در نظر گرفتهشد و ژنهای کنترل کننده صفت دارای سه وضعیت 50 ، 500 و 5000 عدد بودند. همچنین صفت مورد نظر برای 500 حیوان به عنوان جمعیت مرجع با صحت ارزیابی سنتی 0/951 شبیهسازی شد. نتایج نشان دادند در صورت کنترل صفت توسط تعداد کمی ژن ( 50 عدد)، روشهای بیزی دارای صحت و تداوم صحت زیادتری (به دلیل در نظر گرفتن ناهمگنی واریانس برای هر نشانگر و مکانیابی صحیحتر ژنها) نسبت به روشهای BLUP بودند و با افزایش تعداد ژنها این تفاوتها کاهش یافت. اما زمانیکه صفت در کنترل تعداد زیادی ژن بود ( 5000 عدد) روش ChrBLUP با افزایش صحت ارزیابیهای ژنومی نسبت به دیگر روشها (به دلیل در نظر گرفتن ناهمگنی واریانس نشانگرها در هر کروموزم) و نداشتن تفاوت معنیدار در تداوم صحت، روش بهینه تشخیص داده شد. با توجه به اینکه اکثر صفات مهم اقتصادی در صنعت دامپروری توسط تعداد زیادی ژن کنترل میشود، استفاده از روش بهترین پیش بینی نااریب خطی کروموزمی جهت پیش بینی ارزشهای اصلاحی ژنومی این گونه صفات پیشنهاد میشود.کلیدواژه ها
ارزیابی ژنومی، تداوم صحت، روشهای آماریاطلاعات بیشتر در مورد COI
COI مخفف عبارت CIVILICA Object Identifier به معنی شناسه سیویلیکا برای اسناد است. COI کدی است که مطابق محل انتشار، به مقالات کنفرانسها و ژورنالهای داخل کشور به هنگام نمایه سازی بر روی پایگاه استنادی سیویلیکا اختصاص می یابد.
کد COI به مفهوم کد ملی اسناد نمایه شده در سیویلیکا است و کدی یکتا و ثابت است و به همین دلیل همواره قابلیت استناد و پیگیری دارد.