مقایسه بیوانفورماتیکی ژن hrpN مولد هارپین در چند گونه اروینیای واقعی و پکتولیتیک
- سال انتشار: 1391
- محل انتشار: سومین همایش ملی بیوتکنولوژی کشاورزی ایران (گیاهی، دامی و صنعتی)
- کد COI اختصاصی: AGRIBIOTECH03_063
- زبان مقاله: فارسی
- تعداد مشاهده: 832
نویسندگان
دانشجوی فوق لیسانس گروه گیاهپزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه فردوسی
استادیار گروه گیاهپزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه فردوسی مشهد
چکیده
هارپین، پروتئین مقاوم به حرارت، اسیدی، غنی از گلایسین و فاقد سیستئین می باشد که توسط تیپ ترشحی III در چندین جنس گرم منفی باکتریایی ترشح می شود. این مولکول به عنوان الیسیتور واکنش فوق حساسیت در گیاه غیر میزبان و نیز توسعه دهنده بیماری در گیاه میزبان مطرح است. توالی نوکلئوتیدی و اسید آمینه ژن hrpN مولد هارپین متعلق به 5 گونه باکتری گرم منفی از گروه اروینیاهای واقعی و پکتولیتیک از بانک اطلاعاتی ژن، بازیابی و تفاوت در سطح ژن و پروتئین مورد ارزیابی قرار گرفت. تنوع در طول توالی نوکلئوتیدی و ترتیب قرار گرفتن نوکلئوتیدها در بین گونه های اروینیای واقعی در مقایسه با اروینیاهای پکتولیتیک بیشتر بود. در درخت فیلوژنتیک ترسیمی، این ژن امکان تفکیک بین گونه های جنس Erwinia و دو جنس پکتولیتیک Dickeya و Pectobacterium را مهیا نموده است.کلیدواژه ها
اروینیا، آنالیز بیوانفورماتیک، پکتولیتیک، هارپینمقالات مرتبط جدید
- تاثیرات درمانی زردچوبه در طب سنتی و نوین: شباهتها، تفاوت ها و چالشها
- طراحی، ساخت و ارزیابی ماشین برداشت ردیفی زیره
- بررسیفیزیولوژی - فارماکودینامیک فرآورده های گیاهی در درمان لیکن پالن دهان ی
- A review on the use of artificial intelligence in the ornamental fish
- Study on the correlation Coefficients of morphological traits in Pinto Beans (Phaseolus vulgaris L.) Under salinity and drought stress
اطلاعات بیشتر در مورد COI
COI مخفف عبارت CIVILICA Object Identifier به معنی شناسه سیویلیکا برای اسناد است. COI کدی است که مطابق محل انتشار، به مقالات کنفرانسها و ژورنالهای داخل کشور به هنگام نمایه سازی بر روی پایگاه استنادی سیویلیکا اختصاص می یابد.
کد COI به مفهوم کد ملی اسناد نمایه شده در سیویلیکا است و کدی یکتا و ثابت است و به همین دلیل همواره قابلیت استناد و پیگیری دارد.