محمد فاضل سلطانی - دانشجوی کارشناسی ارشد اصلاح نباتات دانشکده کشاورزی دانشگاه شیراز
محسن جم - دانشجوی کارشناسی ارشد اصلاح نباتات دانشکده کشاورزی دانشگاه شیراز
عباس عالم زاده - استادیار بخش زراعت و اصلاح نباتات دانشکده کشاورزی دانشگاه شیراز

به منظور مقایسه و بررسی ترجیح کدونی ژن هایا رمز کننده فسفات ترانسپورتر در گیاهان مختلف توالی 50 آیزوفرم از 7 گیاه مختلف از پایگاه NCBI تهیه شد و توسط برنامه Gene Infinity مورد تجزیه و تحلیل قرار گرفت و با استفاده از تجزیه کلاستر میزان تشایه ترجیح کدنی ژن های رمز کننده فسفات ترانسپورتر مشخص شد. نتایج نشان داد که برای اکثر اسید آمینه ها کدونی ترجیح داده شده بود که نوکلئوتید انتهایی ان G یا C بود و برعکس برای همان اسید امینه ها کمترین ترجیح برای کدونی هایی بود که دارای A یا T T نوکلئوتید آخر خود بودند. در اسیدهای امینه دارای 4 کدون همانند الانین Ala گلایسین Gly پرولین Pro و تیروزین Thr بیشترین ترجیح برای کدونی بود که دارای نوکلئوتید انتهایی C یا G بود. از میان گیاهان مورد بررسی تنها سویا ان هم برای کدن ها اسید امینه ایزولوسیون و چایان بیشتر از کدون هایی استفاده کرده بود که در انتهای خود نوکلئوتید A یا T داشتند. بر اساس نتایج تجزیه کلاستر در مورد کدون های اسید آمینه های 4 و 6 کدنی گیاهان خانواده گندمیان در یک گروه مجزا از سایر گیاهان قرار گرفتند. در نهایت می توان پیشنهاد داد که در اکثر گیاهان مورد بررسی ترجیح کدونی یکسانی برای ژن های رمز کننده فسفات ترانسپورتر وجود دارد و میزان این شباهت در بین گیاهان یک خانواده بیشتر از گیاهان منعلق به خانواده های مختلف است.

ترجیح کدونی ، فسفات ترانسپورتر ، آیزوفرم