پیش بینی و مقایسه بیوانفورماتیکی محل فعالیت پروتئین های فسفات ترانسپورتر در گیاهان و جانوران
- سال انتشار: 1391
- محل انتشار: سومین همایش ملی بیوتکنولوژی کشاورزی ایران (گیاهی، دامی و صنعتی)
- کد COI اختصاصی: AGRIBIOTECH03_049
- زبان مقاله: فارسی
- تعداد مشاهده: 598
نویسندگان
دانشجوی کارشناسی ارشد اصلاح نباتات دانشکده کشاورزی دانشگاه شیراز
دانشجوی کارشناسی ارشد اصلاح نباتات دانشکده کشاورزی دانشگاه شیراز
استادیار بخش زراعت و اصلاح نباتات دانشکده کشاورزی دانشگاه شیراز
چکیده
هان و جانوران تعداد 100 توالی اسید آمینه ای مربوط به این پروتئین ها از پایگاه NCBI گرفته شد و توسط نرم افزا رهای سایت CBS مورد تجزیه و تحلیل قرار گرفت. بررسی ها نشان داد که بیشترین فعالیت این پروتئی نها در گیاهان، در سیتوزول و هسته با 73 % و کمترین فعالیت در کلروپلاست با 7% است. همچنین در جانوران بیشترین فعالیت در مسی رهای ترشحی که به شبکه آندوپلاسمی ختم می شود با 73 % و کمترین فعالیت در میتوکندری با 10 % است. مقایسه اندازه طول توال یها در گیاهان و جانوران نشان داد که طول توالی های موجود در جانوران بزرگتر است که به نظر می رسد به دلیل تعداد بیشتر توالی های پپتید نشانه در انتهای آمینی آ نها است که سبب هدایت این پروتئی نها به سمت محل هدف می شود. همچنین بررس یها نشان داد که برنام هی رایانه ای، محل فعالیت پروتئین های فسفات ترانسپورتر در جانوران را با ضریب اطمینان بیشتری پیش بینی کرده است به طوری که در جانوران 60 % توالی ها با ضریب احتمال بیش از 80 % پیش بینی شده است ولی در گیاهان تنها 5% توالی ها با ضریب احتمال بیش از %80 پیش بینی شده است.کلیدواژه ها
فسفات ترانسپورتر، پپتید نشانه، میتوکندری، شبکه آندوپلاسمیمقالات مرتبط جدید
اطلاعات بیشتر در مورد COI
COI مخفف عبارت CIVILICA Object Identifier به معنی شناسه سیویلیکا برای اسناد است. COI کدی است که مطابق محل انتشار، به مقالات کنفرانسها و ژورنالهای داخل کشور به هنگام نمایه سازی بر روی پایگاه استنادی سیویلیکا اختصاص می یابد.
کد COI به مفهوم کد ملی اسناد نمایه شده در سیویلیکا است و کدی یکتا و ثابت است و به همین دلیل همواره قابلیت استناد و پیگیری دارد.