مدل سازی و بررسی ساختار های اولیه و ثانویه آنتی پورتر واکوئلی NHX در گیاه هالوفیت Leptochloa fusca

  • سال انتشار: 1391
  • محل انتشار: سومین همایش ملی بیوتکنولوژی کشاورزی ایران (گیاهی، دامی و صنعتی)
  • کد COI اختصاصی: AGRIBIOTECH03_039
  • زبان مقاله: فارسی
  • تعداد مشاهده: 2016
دانلود فایل این مقاله

نویسندگان

بهمن پناهی

دانش آموخته کارشناسی ارشد بیو تکنولوژی گیاهی، دانشگاه فردوسی مشهد

نسرین مشتاقی

استادیار بیوتکنولوژی گیاهی، دانشگاه فردوسی مشهد

ابراهیم ترکتاز

دانشجوی دکتری بیوتکنولوژی میکروبی، دانشگاه اصفهان

فرج الله شهریاری

دانشیار بیوتکنولوژی گیاهی، دانشگاه فردوسی مشهد

چکیده

ترانسپورتر های NHX از مهمترین پروتئین های غشایی است که نقش اساسی را در حفظ هموستازی سلولی بر عهده دارد. در گیاهان این آنتی پورتر ها با تخصیص سدیم اضافی به درون واکوئل ها از اثرات سمی این یونها بر سیتوپلاسم سلولی می کاهند. در این تحقیق ساختار های اولیه و ثانویه این انتی پورتر مورد ارزیابی قرار گرفت و مشخص گردید که قسمت اعظم این آنتی پورتر بصورت هیدروفیل می باشد و ساختار ثانویه الفا هلیکس ساختار غالب در این پروتئین می باشد همچنین ساختار سه بعدی این پروتئین نیز با استفاده از نرم افزار مدلر ساخته شد و به منظور پالایش ساختار سه بعدی، تحت کاهش انرژی قرار گرفت. مدل ساخته شده همچنین به منظور ارزیابی کیفیت مدل با استفاده از نمودار راماچاندران و الگوریتم QMEAN مورد ارزیابی قرار گرفت نتایج حاکی از کیفیت بالای مدل ساخته شده بود.

کلیدواژه ها

آنتی پورتر، مدل سازی، ساختار سه بعدی

مقالات مرتبط جدید

اطلاعات بیشتر در مورد COI

COI مخفف عبارت CIVILICA Object Identifier به معنی شناسه سیویلیکا برای اسناد است. COI کدی است که مطابق محل انتشار، به مقالات کنفرانسها و ژورنالهای داخل کشور به هنگام نمایه سازی بر روی پایگاه استنادی سیویلیکا اختصاص می یابد.

کد COI به مفهوم کد ملی اسناد نمایه شده در سیویلیکا است و کدی یکتا و ثابت است و به همین دلیل همواره قابلیت استناد و پیگیری دارد.