علی غفاری - دانشکده مهندسی مکانیک دانشگاه صنعتی خواجه نصیرالدین طوسی
رضا حسن زاده قاسمی - دانشکده مهندسی مکانیک دانشگاه صنعتی خواجه نصیرالدین طوسی
علی شکوه فر - دانشکده مهندسی مکانیک دانشگاه صنعتی خواجه نصیرالدین طوسی

چپرون های مولکولی پروتئین های هستند که برای تاخوردگی صحیح، مونتاژ، انتقال و تخریب پرئتئین ها درون سلول مورد نیاز هستند. پریفولدین (PFD) یک چپرون مولکوی است که در سیتوزول یوکاریوتی و آرکی باکتری وجود داشته و دارای ساختاری شبیه ستاره دریایی با شش بازوی مارپیچی بلند می باشد. در ا ین پژوهش، پریفولدین که دارای مشخصات ظاهری و عملکردی ویژه ای می باشد، به عنوان یک نانو عملگر دارای چند درجه آزادی معرفی شده و به کمک دینامیک مولکولی ( Molecular Dynamics) به تحلیل عملکرد آن پرداخته می شود. اولین گام در شناخت یک نانو عملگرا تحلیل ساختاری آن می باشد. در این گزارش تغییرات ساختاری نانو عملگر پریفولدینی در اثر تغییر پارامتر دما م ورد بررسی قرار گرفته است. ما در این گزارش تغییرات ساختاری نانو عملگر را در دماهای بین 100˚k تا 310˚k مورد بررسی قرار داده ایم. تغییرات دمایی در فواصل دمایی مناسب انجام شده است تا تغییرات ساختاری نانوعملگر به خوبی قابل بررسی باشد. نتایج بدست آمده نشان می دهد، دهانه پریفولدین در دماهای مختلف دارای اندازه متفاوت خواهد بود که آن را برای گرفتن حجم متفاوتی از محموله ها مناسب می کند. به عبارتی از آن می توان برای حمل نانوداروهایی با ابعاد متنوع استفاده کرد. در واقع پارامتری که در این نانوعملگر بسیار جالب توجه است، انعطاف پذیری بازوهای آن است. این ا نعطاف پذیری می تواند به طور شایسته ای برای حمل انواع مختلفی از محموله ها مورد استفاده قرار گیرد.

انعطاف پذیری، پریفولدین، چپرون های مولکولی، دینامیک مولکولی، نرم افزار GROMACS