Bioinformatics analysis of Shwanniomyces occidentalis alpha amylase secretion signal sequences
- سال انتشار: 1389
- محل انتشار: هفدهمین کنفرانس مهندسی پزشکی ایران
- کد COI اختصاصی: ICBME17_277
- زبان مقاله: انگلیسی
- تعداد مشاهده: 1055
نویسندگان
Department of Biotechnology, Faculty of AST, University of Isfahan, Isfahan, Iran
Department of Genetics, Faculty of Science, University of Shahrekord, Shahrekord, Iran
Department of Genetics, Faculty of Science, University of Isfahan, Isfahan, Iran
چکیده
The amy gene from schwaniomyces occidentalis which encodes a secretory alpha amylase isolated by primersthat designed from sequences derived from Gene bank. The isolated gene is then cloned into a p426gpd vector. After cloning, the recombinant vector was transformed into E.Coli DH5x strain and recombinant vector was sent for sequencing by T7, T3 and a mid primer. After sequencing, the sequence of the alpha amylase gene is then converted to amino acid sequence and the new hypothetical protein was analyzed by several signal peptide analysis programs. The cleavage sites and intracellular localization of the protein inside the cell is detected by this analysis. The results showed that schwanniomyces occidentalis alpha amylase has a 25 amino acid long secretory signal peptide that is responsible for initiation of transportation of the enzyme across endoplasmic reticulum, through the secretory pathway and finally secretion out of the cell. Our result would prove veryimportant not only for production of these enzymes but also protein analysis and creating the recombinant organism that produce these enzymes.کلیدواژه ها
signal peptide, Proteins, signalpمقالات مرتبط جدید
- بهینه سازی مدیریت انرژی در ریزشبکه ها با استفاده از الگوریتم های هوش مصنوعی
- مبانی، کاربردها و چالشهای یادگیری مشارکتی و تحلیل تجربی و مقایسه ابزارهای یادگیری فدرالی در پیاده سازی مدلهای یادگیری ماشین
- راهکارهای مبتنی بر هوش مصنوعی برای بهره وری انرژی در تولید سیمان: یک بررسی جامع
- معماری اینترنت اشیا مبتنی بر هوش مصنوعی در مدیریت انرژی هوشمند
- سیستم های EMS/BMS در ساختمان های ZEB و نمونههای اجرا شده آن در سطح جهانی
اطلاعات بیشتر در مورد COI
COI مخفف عبارت CIVILICA Object Identifier به معنی شناسه سیویلیکا برای اسناد است. COI کدی است که مطابق محل انتشار، به مقالات کنفرانسها و ژورنالهای داخل کشور به هنگام نمایه سازی بر روی پایگاه استنادی سیویلیکا اختصاص می یابد.
کد COI به مفهوم کد ملی اسناد نمایه شده در سیویلیکا است و کدی یکتا و ثابت است و به همین دلیل همواره قابلیت استناد و پیگیری دارد.