بررسی بیوانفورماتیکی ژن Dehydrin در جو و چند گیاه مختلف

  • سال انتشار: 1403
  • محل انتشار: دوازدهمین همایش ملی محیط زیست، انرژی و منابع طبیعی
  • کد COI اختصاصی: ECONF12_034
  • زبان مقاله: فارسی
  • تعداد مشاهده: 229
دانلود فایل این مقاله

نویسندگان

لیلا آهنگر

استادیار گروه تولیدات گیاهی، دانشگاه گنبد کاووس

نعیمه واحدی

دانشجوی کارشناسی ارشد بیوتکنولوژی گیاهی، گروه تولیدات گیاهی، دانشگاه گنبد کاووس

چکیده

پروتئین دهیدرین دومین گروه از پروتئین های آبدوست (LEA) proteins Late embryogenesis abundant است که مقدار آن با تنش های محیطی از جمله خشکی در گیاهان افزایش می یابد. در این پژوهش به منظور مطالعه و بررسی بیوانفورماتیکی ژن دهیدرین ، ابتدا توالی این ژن در گیاه جو و چند گیاه دیگر با استفاده از پایگاه داده NCBI بدست آمد. با نرم افزار bioEdit همردیفی توالی ها صورت گرفت . نتایج مطالعات بیانگر این بود که طول این پروتئین در بین گیاهان از ۱۳۳ الی ۲۸۹ اسید آمینه متغییر است . بررسی روابط فیلوژنی نشان داد که ژن دهیدرین در گیاه کاملینا با فاصله زیاد از جو و دیگر گیاهان قرار گرفته است . بیشترین ضریب خاموشی این پروتئین متعلق به گیاه کاملینا با مقدار ۷۴۵۰ بود که بیانگر طول عمر بالای آن است . بررسی جایگاه سلولی نشان داد که این پروتئین با فراوانی بالا در سیتوپلاسم و هسته وجود دارد. از سویی نتایج حاکی از بالا بودن نسبت آب دوستی دهیدرین نسبت به میزان آبگریزی این پروتئین می باشد که با انعطاف پذیری این پروتئین در برابر مقاومت به تنش نقش دارد.

کلیدواژه ها

بیوانفورماتیک ، جایگاه سلولی ، دمین و ژن Dehydrin

مقالات مرتبط جدید

اطلاعات بیشتر در مورد COI

COI مخفف عبارت CIVILICA Object Identifier به معنی شناسه سیویلیکا برای اسناد است. COI کدی است که مطابق محل انتشار، به مقالات کنفرانسها و ژورنالهای داخل کشور به هنگام نمایه سازی بر روی پایگاه استنادی سیویلیکا اختصاص می یابد.

کد COI به مفهوم کد ملی اسناد نمایه شده در سیویلیکا است و کدی یکتا و ثابت است و به همین دلیل همواره قابلیت استناد و پیگیری دارد.