A Multi-Method In-Silico Modeling Approach to Discover Novel PotentialSelective HDAC۸ Inhibitors for Therapeutic Cancer Studies
- سال انتشار: 1402
- محل انتشار: هفتمین کنفرانس بین المللی توسعه فناوری در مهندسی شیمی
- کد COI اختصاصی: CHEMISB07_028
- زبان مقاله: انگلیسی
- تعداد مشاهده: 212
نویسندگان
Chemical and Petroleum Engineering Department, Sharif University of Technology, ۱۱۳۶۵‐۹۴۶۵, Tehran, Iran
Chemical and Petroleum Engineering Department, Sharif University of Technology, ۱۱۳۶۵‐۹۴۶۵, Tehran, Iran
Medical nanotechnology department, Mashhad University of Medical Science, Mashhad, Iran
چکیده
Histone deacetylase ۸ (HDAC۸) is highly expressed in hematological malignancies. Mostavailable HDAC۸ inhibitors possess a hydroxamic acid group, which creates a strong bind withthe zinc ion in HDAC۸. However, this high binding affinity can cause severe side effects.Moreover, other non-selective HDAC۸ inhibitors may have adverse effects. This study aimed toidentify potential, non-hydroxamate, selective, and novel HDAC۸ inhibitors. A pharmacophorehypothesis (AADH-۱) and a quantitative structure-activity relationship (QSAR) model weregenerated using ۶۲ well-known HDAC۸ inhibitors. For virtual screening over۶×۱۰ ۴ moleculesin the ZINC database were applied. For the ۲D-QSAR model, R۲= ۰.۹۰۴۲ for the training setand R۲= ۰.۸۱۸۶ for the test set were calculated and the pharmacophore modeling was validatedwith approved and investigational HDAC۸ inhibitors from DRUGBANK, enhancing itsreliability. The resultant hits with a fitness score > ۱.۷۵ and predicted IC۵۰ < ۸۰ nm werescreened by ADMET predictions (absorption, distribution, metabolism, excretion, and toxicity)and docking investigations. ZINC۰۰۰۰۱۸۹۹, ZINC۰۰۱۸۸۷۷۵, ZINC۰۰۳۷۴۱۰۳, ZINC۰۲۱۰۰۹۲۳, ZINC۰۲۷۶۹۸۹۸, ZINC۰۳۰۳۴۱۷۸, ZINC۰۸۴۲۶۹۹۴, ZINC۳۲۵۵۹۹۲۸ have more affinity towards HDAC۸ and less affinity towards HDAC۳ and HDAC۶. (ZINC۰۰۰۰۱۸۹۹) Penciclovir, used in clinical trials for treating HSV infections, may selectively inhibit HDAC۸ with fewer side effects for related disorders.کلیدواژه ها
QSAR modeling, Molecular Docking, ADME prediction, Pharmacophore modeling, Histone deacetylase ۸, non-hydroxamate and selective ligandsمقالات مرتبط جدید
- سنتز نانو ماده اکسیدگرافن و بررسی تاثیر آن بر روی مقاومت شیمیایی رنگ آلکیدی
- پیش بینی نرخ های تولید چندفازی (نفت، گاز و آب) با استفاده از روش های یادگیری ماشین: مرور بر روش ها و کاربردها
- روشهای کنترل داده محور در مهندسی شیمی
- بررسی جداسازی گاز پروپیلن از پروپان در غشای ۶FDA-durene با استفاده از روش شبیه سازی مولکولی
اطلاعات بیشتر در مورد COI
COI مخفف عبارت CIVILICA Object Identifier به معنی شناسه سیویلیکا برای اسناد است. COI کدی است که مطابق محل انتشار، به مقالات کنفرانسها و ژورنالهای داخل کشور به هنگام نمایه سازی بر روی پایگاه استنادی سیویلیکا اختصاص می یابد.
کد COI به مفهوم کد ملی اسناد نمایه شده در سیویلیکا است و کدی یکتا و ثابت است و به همین دلیل همواره قابلیت استناد و پیگیری دارد.