Differential Abundance Analysis of Gut Microbiome between HealthyControls and Colorectal Cancer Patients
- سال انتشار: 1402
- محل انتشار: سومین کنفرانس ملی یافته های نوین زیست شناسی
- کد COI اختصاصی: BIOC03_241
- زبان مقاله: انگلیسی
- تعداد مشاهده: 216
نویسندگان
Ph.D. in Molecular Genenetics, Department of Biology, University of Sistan andBaluchestan, Zahedan, Iran
Professor, Department of Biology, University of Sistan and Baluchestan, Zahedan, Iran
Assistant Professor, Department of Biology, University of Sistan and Baluchestan, Zahedan,Iran.
Infectious Diseases and Tropical Medicine Research Center, Resistant TuberculosisInstitute, Zahedan University of Medical Sciences, Zahedan, Iran
چکیده
Colorectal cancer (CRC) is a significant public health burden, accounting for approximately۱۰% of all new cancer cases worldwide. The causes of CRC are complex and environmentalfactors play a stronger role than genetic factors. The gut microbiome has been linked toseveral bowel cancers, such as CRC. Biopsy samples were taken from normal mucosa ofhealthy controls (HC) and tumor of CRC patients during colonoscopy. The microbiome oftumor tissue and normal mucosa was evaluated by ۱۶S rRNA gene amplicon sequencing.Differential abundance analysis of CRC versus HC groups showed that Enterobacteriaceae,Bacteroides fragilis, Prevotella, Fusobacterium, Leptotrichia, Akkermansia muciniphila,Streptococcus, and Parabacteroides have drastic fold changes (P ≤ ۰.۰۵). A heat map anddendrogram of the ۲۰ ascending operational taxonomic units (OTUs) based on the FDR(False Discovery Rate) p-value were constructed to visualize the similarity between samples.The significant difference in the differential abundance of bacteria taxa in CRC versus HCgroups indicates that these bacteria can be important pathogens in the development andprogression of CRC.کلیدواژه ها
Colorectal cancer, Microbiome, ۱۶S rRNA sequencing, Differential abundanceanalysis, Operational taxonomic unitsمقالات مرتبط جدید
- تولید آنتی بادی پلی کلونال مونواسپسیفیک جهت شناسایی باکتریهای جنس سالمونلا
- بررسی فراوانی سویه های مدرن و اجدادی مایکوباکتریوم توبرکلوزیس بر اساس نشانگر TbD۱ در شمال غرب ایران
- The impact of the gut microbiome on metabolic, psychiatric, and immune diseases
- پیشگیری از سرطان خون سفری به سوی زندگی سالمتر
- Investigating the Effect of Pulegone and Neomenthol Compounds in Cancer Inhibition Using Molecular Docking
اطلاعات بیشتر در مورد COI
COI مخفف عبارت CIVILICA Object Identifier به معنی شناسه سیویلیکا برای اسناد است. COI کدی است که مطابق محل انتشار، به مقالات کنفرانسها و ژورنالهای داخل کشور به هنگام نمایه سازی بر روی پایگاه استنادی سیویلیکا اختصاص می یابد.
کد COI به مفهوم کد ملی اسناد نمایه شده در سیویلیکا است و کدی یکتا و ثابت است و به همین دلیل همواره قابلیت استناد و پیگیری دارد.