بررسی بیوانفورماتیکی اثر miRNAs بر بیان ژن های دخیل در فرآیند نورون-زایی در مغز ماهی گورخری (Danio rerio)
- سال انتشار: 1398
- محل انتشار: فصلنامه فیزیولوژی و بیوتکنولوژی آبزیان، دوره: 7، شماره: 3
- کد COI اختصاصی: JR_JAPB-7-3_004
- زبان مقاله: فارسی
- تعداد مشاهده: 34
نویسندگان
استادیار گروه شیلات، دانشکده منابع طبیعی و محیط زیست، دانشگاه صنعتی خاتم الانبیاء (ص) بهبهان، بهبهان، ایران
کارشناس ارشد تکثیر و پرورش آبزیان، گروه شیلات، دانشکده منابع طبیعی و محیط زیست، دانشگاه صنعتی خاتم الانبیاء (ص) بهبهان، بهبهان، ایران
چکیده
microRNAهای (miRNA) مختلفی در فرآیند تمایز سلولهای عصبی و نورونزایی در مغز مهرهداران نقش دارند، اما بررسیهای انجام شده بر miRNAهای در ماهیان و تعیین ژنهای هدف آن ها بسیار محدود است. ریزآرایه به عنوان یک روش استاندارد برای مطالعه کلی ژنهای تحت کنترل miRNA ها است. اما هزینه بسیار زیاد این روش، استفاده از آن را در بسیاری از مواقع محدود کرده است. این در حالی است که با پیشرفت الگوریتم بیوانفورماتیکی و مدلسازی کامپیوتری میتوان اهداف mRNA را برای miRNA پیشبینی کرد. از این رو، در مطالعه حاضر تلاش شده است تا از طریق بررسی بیوانفورماتیک ژنها و miRNAهای دخیل در تنظیم ژنهای فعال در تمایز سلولهای عصبی و نورونزایی در مغز ماهی گورخری، با استفاده از نرمافزارهای پایگاههای Target Scan و DIANA ژنها و miRNAهای مربوطه شناسایی شود. نتایج بررسیهای بیوانفورماتیکی انجام شده نشان داد که بیان ژنهای neurod۶b، neurod۲، neurod۴، olfm۱a و olfm۱b، gle۱، sox۱۱a و sox۱۱b، cadm۱b، notch۲ و notch۱b با بیشترین احتمال ممکن است در مسیر نورون زایی تحت تاثیر dre-miRNAs قرار گیرند. از این رو به نظر میرسد که محصول این ژنها میتواند به عنوان کاندیدای مناسب جدیدی برای بررسیهای تجربی شناخت مسیر نورونزایی در مغز ماهی گورخری در نظر گرفته شود.کلیدواژه ها
miRNAs, Target Scan, Diana, ماهی گورخری, نورون زاییاطلاعات بیشتر در مورد COI
COI مخفف عبارت CIVILICA Object Identifier به معنی شناسه سیویلیکا برای اسناد است. COI کدی است که مطابق محل انتشار، به مقالات کنفرانسها و ژورنالهای داخل کشور به هنگام نمایه سازی بر روی پایگاه استنادی سیویلیکا اختصاص می یابد.
کد COI به مفهوم کد ملی اسناد نمایه شده در سیویلیکا است و کدی یکتا و ثابت است و به همین دلیل همواره قابلیت استناد و پیگیری دارد.