بررسی پتانسیل واکسن بودن پروتئین VceC علیه باکتری بیماری زای آبزی Vibrio cholerae و طراحی واکسن پپتیدی زیرواحدی بر اساس توالی آمینواسیدی این پروتئین با روش های تجزیه و تحلیل بیوانفورماتیک

سال انتشار: 1401
محل انتشار: فصلنامه فیزیولوژی و بیوتکنولوژی آبزیان، دوره: 10، شماره: 1
کد COI اختصاصی: JR_JAPB-10-1_008
زبان مقاله: فارسی
تعداد مشاهده: 44

نویسندگان

استادیار گروه زیست شناسی، دانشگاه صنعتی خاتم الانبیاء بهبهان، بهبهان، ایران

چکیده

Vibrio cholerae یک باکتری بیماری زای آبزی است که سویه های مختلف آن باعث ایجاد بیماری هایی چون وبا، اسهال حاد، مننژیت و سپتی سمی می شوند. با توجه به مقاومت سویه ها به آنتی بیوتیک های گوناگون، تولید واکسن های موثر بر تمامی سویه های بیماری زا می تواند یکی از بهترین روش های مبارزه باشد. از این رو، در این مطالعه پتانسیل واکسن بودن پروتئین VceC علیه باکتری V. cholerae با استفاده از روش های بیوانفورماتیکی مورد بررسی قرار گرفت و در کنار تعیین ویژگی های آنتی ژنی، ویرولانسی و فیزیکوشیمیایی پروتئین نام برده، نقشه برداری اپیتوپ های B و T به منظور طراحی بهترین واکسن زیرواحدی انجام شد. نتایج نشان داد که این پروتئین دارای ویژگی های بهینه از جمله حضور در سطح تمامی سویه های مورد مطالعه، پایداری و نیمه عمر بالا، مقاومت به دما و همچنین حلال بودن در هنگام بیش بیانی است. همچنین نقاط آنتی ژنیک و اپیتوپ های خطی و فضایی زیادی در طول توالی و ساختار پروتئین مشاهده شد. با توجه به موقعیت مکانی و ویژگی های آنتی ژنیک، دو واکسن زیرواحدی خطی و فضایی طراحی شد که می توانند علیه بیماری زایی سویه های مختلف باکتری V. cholerae مورد آزمایش و استفاده قرار گیرند.

کلیدواژه ها

V. cholerae, وبا, واکسن, بیوانفورماتیک, نقشه برداری اپیتوپ

اطلاعات بیشتر در مورد COI

COI مخفف عبارت CIVILICA Object Identifier به معنی شناسه سیویلیکا برای اسناد است. COI کدی است که مطابق محل انتشار، به مقالات کنفرانسها و ژورنالهای داخل کشور به هنگام نمایه سازی بر روی پایگاه استنادی سیویلیکا اختصاص می یابد.

کد COI به مفهوم کد ملی اسناد نمایه شده در سیویلیکا است و کدی یکتا و ثابت است و به همین دلیل همواره قابلیت استناد و پیگیری دارد.