تنوع ژنتیکی میگوی سرتیز Metapenaeus affinis در خلیج فارس بر اساس توالی ژن میتوکندریایی ۱۶S rRNA
- سال انتشار: 1394
- محل انتشار: فصلنامه فیزیولوژی و بیوتکنولوژی آبزیان، دوره: 3، شماره: 2
- کد COI اختصاصی: JR_JAPB-3-2_004
- زبان مقاله: فارسی
- تعداد مشاهده: 45
نویسندگان
دانشگاه هرمزگان
دانشگاه هرمزگان
پژوهشکده اکولوژی خلیج فارس و دریای عمان
دانشگاه هرمزگان
چکیده
میگوی سرتیز رتبه دوم میزان صید میگوی را در استان هرمزگان داشته و در چرخه صید و صیادی خلیج فارس اهمیت زیادی دارد. از این رو، بررسی تنوع ژنتیکی این گونه مهم مد نظر قرار گرفت. نمونه های میگو از سه منطقه بندرعباس، بوشهر و آبادان جمع آوری شدند و برای توالی یابی ژن میتوکندریایی ۱۶S rRNA مورد بررسی قرار گرفتند. بهینه سازی واکنش PCR جهت تکثیر ژن انجام شد. نتایج توالی یابی ژن ۱۶S rRNA که شامل ۴۸۶ باز هم ردیف شده بود، ۴۸۰ جایگاه ژنی مونومورف، ۶ جایگاه ژنی پلی مورف و ۲ جایگاه انتقالی نشان داد. میانگین تنوع هاپلوتیپی برای نمونه های هر منطقه از ۰۰۰/۰±۰۰۰/۰ (بندرعباس) تا ۲۱۵/۰±۳۳۳/۰ (بوشهر) و ۲۱۵/۰±۳۳۳/۰ (آبادان) و میانگین تنوع نوکلئوتیدی برای نمونه های هر منطقه از ۰۰۰/۰±۰۰۰/۰ (بندرعباس) تا ۰۰۳/۰± ۰۰۳/۰ (بوشهر) و ۰۰۱/۰±۰۰۱/۰ (آبادان) متغیر بود. میانگین تنوع هاپلوتیپی بین سه منطقه ۰۰۷/۰±۶۰۸/۰ و میانگین تنوع نوکلئوتیدی ۰۰۳/۰±۰۰۲/۰ محاسبه شد. نتایج بیانگر متوسط بودن میزان تنوع هاپلوتیپی و کم بودن میزان تنوع نوکلئوتیدی در مناطق مورد مطالعه بود. از آنجا که یکی از علل کاهش شدید جمعیت ها، فقدان تنوع ژنتیکی است، ارزیابی نتایج این بررسی و به کارگیری آن می تواند راه گشای مدیریت شیلاتی در بازسازی صحیح ذخایر این گونه با ارزش شود.کلیدواژه ها
تعیین توالی, تنوع ژنتیکی, خلیج فارس, ۱۶S rRNA, Metapenaeus affinisاطلاعات بیشتر در مورد COI
COI مخفف عبارت CIVILICA Object Identifier به معنی شناسه سیویلیکا برای اسناد است. COI کدی است که مطابق محل انتشار، به مقالات کنفرانسها و ژورنالهای داخل کشور به هنگام نمایه سازی بر روی پایگاه استنادی سیویلیکا اختصاص می یابد.
کد COI به مفهوم کد ملی اسناد نمایه شده در سیویلیکا است و کدی یکتا و ثابت است و به همین دلیل همواره قابلیت استناد و پیگیری دارد.