Biochemical Pathway and Protein-Network Analysis of Dental Caries Based on Systems Biology Approaches
- سال انتشار: 1402
- محل انتشار: مجله بیوشیمی پزشکی، دوره: 11، شماره: 1
- کد COI اختصاصی: JR_MEBIO-11-1_003
- زبان مقاله: انگلیسی
- تعداد مشاهده: 44
نویسندگان
چکیده
Background: Tooth decay (TD) is a multifactorial disorder, and several factors are involved in its etiology. Objective: The present study aimed to unravel the main genes and molecular mechanisms underlying TD. Methods: The dataset GSE۱۶۲۹ in the Gene Expression Omnibus (GEO) database was analyzed to uncover differentially expressed genes (DEGs) in patients with TD compared to patients with sound teeth. A protein-protein interaction network was built, and the most important clusters, hub genes, transcription factors (TFs), and protein kinases involved in the regulation of TFs were disclosed. Signaling pathways and Gene Ontology terms dysregulated in TD were also identified. Results: A total of ۱۹۶ DEGs were determined (false discovery rate< ۰.۰۰۱; |Log۲ fold change|> ۱). PTPRC, ITGB۲, TYROBP, MMP۹, CXCL۸, CD۴۴, CCL۲, C۱QB, C۳, and SPP۱ were considered hub genes. Further, BPTF and MAPK۱ were demonstrated to be the highest TFs and protein kinases likely involved in the pathogenesis of TD, respectively. Conclusion: PTPRC, ITGB۲, TYROBP, MMP۹, CXCL۸, CD۴۴, CCL۲, C۱QB, C۳, SPP۱, BPTF, and MAPK۱ may be regarded as potential markers for the therapeutic purposes of TD.کلیدواژه ها
اطلاعات بیشتر در مورد COI
COI مخفف عبارت CIVILICA Object Identifier به معنی شناسه سیویلیکا برای اسناد است. COI کدی است که مطابق محل انتشار، به مقالات کنفرانسها و ژورنالهای داخل کشور به هنگام نمایه سازی بر روی پایگاه استنادی سیویلیکا اختصاص می یابد.
کد COI به مفهوم کد ملی اسناد نمایه شده در سیویلیکا است و کدی یکتا و ثابت است و به همین دلیل همواره قابلیت استناد و پیگیری دارد.