بررسی خصوصیات فنوتیپی و تنوع ژنتیکی جدایه هایPseudomonas syringae pv. syringae عامل شانکر باکتریایی بادام در استان خراسان رضوی با استفاده از BOX-PCR
- سال انتشار: 1394
- محل انتشار: مجله تحقیقات بیماری های گیاهی، دوره: 3، شماره: 1
- کد COI اختصاصی: JR_RPPM-3-1_001
- زبان مقاله: فارسی
- تعداد مشاهده: 153
نویسندگان
دانش آموخته گروه بیماری شناسی گیاهی دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی گرگان
دانشیار گروه بیماری شناسی گیاهی دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی گرگان
استاد دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی ساری
مربی پژوهش مرکز تحقیقات علوم کشاورزی و منابع طبیعی خراسان رضوی
مربی دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی گرگان
چکیده
شانکر باکتریایی که بوسیله پاتوارهای Pseudomonas syringae Van Hallایجاد میشود یکی از مشکلات جدی باغهای درختان میوه هستهدار میباشد. در این تحقیق طی سالهای ۱۳۹۱-۱۳۹۰ نمونه های دارای علائم شانکر از باغات بادام در استان خراسان رضوی جمع آوری شده و جداسازی باکتری انجام شد. عامل بیماری براساس آزمونهای گروه LOPAT و GATTa، (Pss)Pseudomonas syringae pv. Syringae شناسایی شد. شانزده جدایه خالص سازی شده و مورد بررسیهای فیزیولوژیکی و بیوشیمیایی قرار گرفتند. جدایهها براین اساس اختلافات جزئی نشان دادند. تشخیص مولکولی جدایه ها با واکنش زنجیره ای پلیمراز با آغازگرهای اختصاصی D۲۱ و D۲۲ صورت گرفت. به منظور ارزیابی دامنه تنوع ژنتیکی جدایهها، از روش BOX-PCR استفاده شد. از ضریب تشابه جاکارد (Jaccard) برای تعیین تشابه جدایهها و از روش UPGMA و نرم افزار NTYSYS-pc برای آنالیز خوشهای استفاده شد. در آنالیز خوشهای دادهها، جدایهها با آغازگر BOXA۱R در سطح تشابه ۶۸ درصد، در ۳ گروه قرار گرفتند. نتایج، بیانگر تنوع ژنتیکی جدایههای عامل بیماری شانکر درختان بادام در استان خراسان رضوی است.کلیدواژه ها
Pseudomonas syringae pv. syringae, شانکر باکتریایی, بادام, تنوع ژنتیکی, BOX-PCRاطلاعات بیشتر در مورد COI
COI مخفف عبارت CIVILICA Object Identifier به معنی شناسه سیویلیکا برای اسناد است. COI کدی است که مطابق محل انتشار، به مقالات کنفرانسها و ژورنالهای داخل کشور به هنگام نمایه سازی بر روی پایگاه استنادی سیویلیکا اختصاص می یابد.
کد COI به مفهوم کد ملی اسناد نمایه شده در سیویلیکا است و کدی یکتا و ثابت است و به همین دلیل همواره قابلیت استناد و پیگیری دارد.