Identification of a Prognostic Biomarker for Colorectal Cancer usingBioinformatics Abstract
- سال انتشار: 1402
- محل انتشار: دومین همایش بین المللی زیست شناسی و علوم آزمایشگاهی
- کد COI اختصاصی: ZISTCONF02_150
- زبان مقاله: انگلیسی
- تعداد مشاهده: 125
نویسندگان
Zist Fanavari Novin Biotechnology Institue, Isfahan, Iran
Zist Fanavari Novin Biotechnology Institue, Isfahan, Iran
Zist Fanavari Novin Biotechnology Institue, Isfahan, Iran
چکیده
Colorectal cancer (CRC) is the third leading cause of cancer-related deaths globally.Microarray data analysis is a useful method for classifying malignancies and makingprognostic assessments. In a recent study, In a recent study, differentially expressed genes(DEGs) were obtained from gene expression omnibus (GEO) to identify CRC-associatedgenes. Differentially expressed genes (DEGs) among GSE۳۷۱۸۲ were identified, including۴۰ upregulated genes and ۱۲۸ downregulated genes.According to the study, the KyotoEncyclopedia of Genes and Genomes pathway (KEGG) was conducted to identify the mostsignificant in colorectal cancer (CRC). The Bile Secretion signaling pathway is an importantmetabolic pathway that plays a crucial role in the secretion of bile by the liver. AQP۸, whichwas identified as a significant gene in colorectal cancer in the study, is involved in thispathway. Specifically, AQP۸ is involved in the transport of water across the cell membrane,which is necessary for the formation and secretion of bile.Then, we created protein-proteininteraction networks of these common DEGs using STRING, which resulted in theidentification of the following ۱۰ nodes including, AQP۱, AQP۲, AQP۳, AQP۷, AQP۹,AQP۱۰, AQP۱۱, AQP۱۲a, MIP and MS۴A۱۲. In this research, bioinformatics studies wereconducted to select a biomarker for colon cancer.کلیدواژه ها
CRC, Bimarker, GEO, AQP۸, Bioinformaticمقالات مرتبط جدید
- استفاده از جلبک ها در تصفیه پساب فاضلاب: بررسی روش ها، چالش ها و کاربردها
- Isolation and Identification of Effective Probiotics on Staphylococcusepidermidis Strains Isolated from Urine Sample
- اولین گزارش از انگل های خونی میکروسکوپی در وزغ تالشی(Bufo eichwaldi)در شمال ایران
- "Computational Analysis of Isoliquiritigenin as a Potential MAPK۳ Inhibitorin Rectal Cancer: Integrating Transcriptomics, Molecular Docking, andDynamics Simulations"
- “Targeting MMP۷ in Rectal Cancer: Exploring the Therapeutic Potential ofBerberine through Bioinformatics and Molecular Docking Approaches”
اطلاعات بیشتر در مورد COI
COI مخفف عبارت CIVILICA Object Identifier به معنی شناسه سیویلیکا برای اسناد است. COI کدی است که مطابق محل انتشار، به مقالات کنفرانسها و ژورنالهای داخل کشور به هنگام نمایه سازی بر روی پایگاه استنادی سیویلیکا اختصاص می یابد.
کد COI به مفهوم کد ملی اسناد نمایه شده در سیویلیکا است و کدی یکتا و ثابت است و به همین دلیل همواره قابلیت استناد و پیگیری دارد.