شناسایی آنچوی ماهیان گونه های Encrasicholina punctifer و pseudoheteroloba Encrasicholina با استفاده از ژن COI به عنوان یک نشانگر DNA بارکد
- سال انتشار: 1396
- محل انتشار: مجله بوم شناسی آبزیان، دوره: 7، شماره: 3
- کد COI اختصاصی: JR_JAEJ-7-3_004
- زبان مقاله: فارسی
- تعداد مشاهده: 121
نویسندگان
Department of Fisheries, Faculty of Marine Science and Technology, University of Hormozgan, Bandar Abbas, Iran
Department of Fisheries, Faculty of Marine Science and Technology, University of Hormozgan, Bandar Abbas, Iran
مرکز ملی ذخایر ژنتیکی و زیستی ایران، جهاد دانشگاهی، تهران
Department of Fisheries, Faculty of Marine Science and Technology, University of Hormozgan, Bandar Abbas, Iran
چکیده
جنس Encrasicholina شامل آنچوی ماهیان کوچک پلاژیک است که گونه های آن فقط در آب های اقیانوس هند و آرام پراکنش دارند و از نظر اقتصادی و اکولوژیکی بسیار حائز اهمیت می باشند. تاکنون از این جنس سه گونه در آب های ایرانی خلیج فارس گزارش شده است. با توجه به فعالیت های مختلف انسانی در دهه های اخیر، اکوسیستم خلیج فارس آسیب های جدی را متحمل شده است و تنوع زیستی آن دچار تهدید شده است. در این میان بیشتر گونه های سطح زی با خطر انقراض مواجه هستند، بنابراین توسعه پایدار این منابع و حفاظت از تنوع زیستی امری ضروری به نظر می رسد. اولین گام برای رسیدن به این هدف شناسایی دقیق گونه ها می باشد. روش بارکد گذاری DNA بر اساس DNA میتوکندریایی یکی از جدیدترین روش های مولکولی برای شناسایی و همچنین بررسی روابط فیلوژنتیکی گونه هاست. در این تحقیق، ژن میتوکندریایی سیتوکروم اکسیداز زیر واحد۱(COI) برای شناسایی گونه های متعلق به Encasicholina درخلیج فارس مورد ارزیابی قرارگرفت. نتایج شناسایی مورفولوژیکی با توالی های ارسال شده به کتابخانه بارکد موجودات و بانک ژن مطابقت داشت، همچنین لاروهایی که ویژگیهای مورفولوژیکی آنها برای شناسایی کافی نبود، به طور قابل اعتماد و دقیقی با توالی یابی این ژن شناسایی شدند. تنوع ژنتیکی درون گونه ای بر اساس مدل دو پارامتری کیمورا صفر بود، در حالی که میانگین تنوع بین دو گونه ۹/۱۸ درصد بود. درخت فیلوژنی رسم شده نشان داد که گونه های مورد مطالعه مربوط به دو کلاد خواهری هستند. نتایج این مطالعه نشان می دهد که ژن COI توانایی تشخیص گونه های مورد مطالعه را دارد و نتایج مطالعات مولکولی و مورفولوژیکی مطابقت داشتند.کلیدواژه ها
DNA Barcoding, Cytochrome oxidase, subunit۱ gene, Encrasicholina, Persian Gulf, Encrasicholina, بارکد گذاری DNA, خلیج فارس, ژن سیتوکروم اکسیداز زیرواحد ۱اطلاعات بیشتر در مورد COI
COI مخفف عبارت CIVILICA Object Identifier به معنی شناسه سیویلیکا برای اسناد است. COI کدی است که مطابق محل انتشار، به مقالات کنفرانسها و ژورنالهای داخل کشور به هنگام نمایه سازی بر روی پایگاه استنادی سیویلیکا اختصاص می یابد.
کد COI به مفهوم کد ملی اسناد نمایه شده در سیویلیکا است و کدی یکتا و ثابت است و به همین دلیل همواره قابلیت استناد و پیگیری دارد.