مقایسه ماتریس های روابط خویشاوندی ژنومی متفاوت در پویش ژنومی وزن دهی شده چند جمعیتی
عنوان مقاله: مقایسه ماتریس های روابط خویشاوندی ژنومی متفاوت در پویش ژنومی وزن دهی شده چند جمعیتی
شناسه ملی مقاله: JR_JASR-15-4_009
منتشر شده در در سال 1402
شناسه ملی مقاله: JR_JASR-15-4_009
منتشر شده در در سال 1402
مشخصات نویسندگان مقاله:
سید مصطفی مظلوم - گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه فردوسی مشهد، مشهد، ایران
محمد مهدی شریعتی - گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه فردوسی مشهد، مشهد، ایران
خلاصه مقاله:
سید مصطفی مظلوم - گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه فردوسی مشهد، مشهد، ایران
محمد مهدی شریعتی - گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه فردوسی مشهد، مشهد، ایران
هدف از پژوهش حاضر، انتخاب بهترین ماتریس روابط خویشاوندی ژنومی برای پویش ژنومی چندجمعیتی است. ساختار ژنتیکی جمعیتها منحصر به فرد هستند، بنابراین برای تشکیل ماتریس روابط خویشاوندی ژنومی چند جمعیتی از ماتریس روابط خویشاوندی ژنومی بلوکبندی شده استفاده می شود. در این مطالعه، ابتدا دو جمعیت با ساختار ژنتیکی متفاوت شبیهسازی شدند. سپس ماتریس روابط خویشاوندی ژنومی معمولی (G)، ماتریس روابط خویشاوندی ژنومی بلوکبندی شده (BG) و ماتریس روابط خویشاوندی ژنومی بلوکبندی وزندهی شده با واریانس ژنوتیپی برآورد شده با بیز B (WBG) برای حیوانات تشکیل شدند و برای مطالعات پویش ژنومی تک مرحلهای استفاده شدند. علاوه بر آن، با روش بیزB پویش ژنومی انجام شد و با پویش های ژنومی تک مرحلهای مقایسه شدند. نتایج پویش ژنومی با استفاده از ماتریسهای روابط خویشاوندی G، BG و WBG نشان داد که به طور میانگین به ترتیب ۱۴، ۱۶، ۲۱ نشانگر ژنومی مرتبط با QTL های صفات شناسایی شدند که واریانس ژنتیکی توجیه شده بالای یک درصد دارند. همچنین با استفاده از روش آماری بیز B تنها دو نشانگر ژنومی با واریانس بالای یک درصد شناسایی شدند. علاوه براین، میانگین صحتهای پیشبینی ارزش اصلاحی ژنومی در لحظه همگرایی با استفاده از ماتریسهای G، BG و WBG به ترتیب ۳۶/۰، ۳۹/۰، ۴۳/۰ برآورد شدند. نتیجه گیری کلی نشانداد که استفاده از ماتریسهای روابط خویشاوندی ژنومی BG و WBG میتواند باعث بهبود پویش ژنومی چندجمعیتی یا چندنژادی شود.
کلمات کلیدی: بیزB, پویش ژنومی چند جمعیتی, ماتریس روابط خویشاوندی ژنومی بلوکی, ماتریس روابط خویشاوندی ژنومی
صفحه اختصاصی مقاله و دریافت فایل کامل: https://civilica.com/doc/1875386/