بررسی داکینگ مولکولی آورانتامید موجود در گیاه دارویی مورینگا الیفرا (Moringa Olifera) بر مهار پروستاگلاندین ها

  • سال انتشار: 1402
  • محل انتشار: فصلنامه کیفیت و ماندگاری تولیدات کشاورزی و مواد غذایی، دوره: 3، شماره: 2
  • کد COI اختصاصی: JR_QAJF-3-2_004
  • زبان مقاله: فارسی
  • تعداد مشاهده: 248
دانلود فایل این مقاله

نویسندگان

حمیده خواجه

کارشناس ارشد پژوهشکده زیست فناوری دانشگاه زابل، زابل ایران

زهرا جمعه قاسم ابادی

دانشجوی دکتری بیوتکنولوژی دانشکده کشاورزی دانشگاه زابل، زابل، ایران

چکیده

درد مکانیسمی دفاعی محسوب می شود و هنگامی که بافتی دچار آسیب شود، ایجاد می گردد. گیرنده های درد در پوست و بافت ها، انتهای عصبی آزاد هستند. ایجاد درد در بافت ها به علت ساخته شدن موادی به نام پروستاگلاندین ها که از مهم ترین واسطه های التهاب می باشد و مهار ساخت آن توسط داروهای ضد التهاب موجب کاهش آن می شود. گیاه مورینگا الیفرا در صنایع غذا و دارو اهمیت بالایی دارد و دارای ترکیب دارویی نادر به نام آورانتی آمید (Auranti amide) می باشد. این ترکیب به دلیل اثرات ضدالتهابی و ضدروماتیسمی خود، در درمان بیماری های التهابی مانند آرتروز، روماتوئید و پسوریازیس کاربرد دارد و با ممانعت از تولید پروستاگلاندین ها و افزایش تولید گلوتاتیون، کاهش فعالیت آنزیم های آسپارتات آمینوترانسفراز و آلانین آمینوترانسفراز و کاهش تولید عامل التهابی TNF-α، عوارض التهابی را کاهش می دهد. هدف از این مطالعه بررسی اثر مهاری ترکیب دارویی اورانتامید بروی پروستاگلاندین ها از طریق داکینگ مولکولی می باشد. برای بررسی نحوه اتصال ترکیب دارویی به جایگاه فعال مولکول، ترسیم ساختار شیمیایی دارو، بهینه سازی انرژی، مطالعات داکینگ، تجزیه و تحلیل های نهایی از پایگاه داده های Pub Chem و PDB استفاده شد. میانکنش دارو با رسپتور از طریق داک های متفاوت با استفاده از نرم افزار های Pyrex، Chimera و Viewer Lite انجام شد. نتایج نشان داد که ترکیب مورد نظر قادر به اشغال جایگاه فعال آنزیم بود و در میان نرم افزارها بهترین نتیجه با استفاده از نرم افزار Pyrex بدست آمد. در واقع این ترکیب دارای منفی ترین سطح انرژی اتصال (Kcal mol ۵/۷-) بود. بنابراین نشان داده شد که بالاترین تمایل به آمینواسیدهای کلیدی جایگاه فعال آنزیم و محل برهمکنش با مولکول کوکریستال است.

کلیدواژه ها

داکینگ مولکولی, بیوانفورماتیک, آورانتامید, مورینگا, پروستاگلاندین

اطلاعات بیشتر در مورد COI

COI مخفف عبارت CIVILICA Object Identifier به معنی شناسه سیویلیکا برای اسناد است. COI کدی است که مطابق محل انتشار، به مقالات کنفرانسها و ژورنالهای داخل کشور به هنگام نمایه سازی بر روی پایگاه استنادی سیویلیکا اختصاص می یابد.

کد COI به مفهوم کد ملی اسناد نمایه شده در سیویلیکا است و کدی یکتا و ثابت است و به همین دلیل همواره قابلیت استناد و پیگیری دارد.