بکارگیری روش HRM در شناسایی و تفریق جدایه های ایرانی ویروس بیماری نیوکاسل از سویه های واکسینال
- سال انتشار: 1393
- محل انتشار: فصلنامه پاتوبیولوژی مقایسه ای، دوره: 11، شماره: 3
- کد COI اختصاصی: JR_JCPS-11-3_003
- زبان مقاله: فارسی
- تعداد مشاهده: 116
نویسندگان
چکیده
برای کنترل همه گیری ها لازم است تا حضور ویروس های حاد از واکسن در کمترین زمان ممکن و با بیشترین دقت تشخیص داده شود. هدف از این مطالعه، بکارگیری روش HRM (High-Resolution Melting-Curve Analysis) در شناسایی و تفریق جدایه های بومی ویروس بیماری نیوکاسل از سویه های واکسن بود. در این مطالعه ۵ جدایه حادNDV همراه با ۶ نمونه از واکسن های نیوکاسل موجود در بازار ایران مورد استفاده قرار گرفتند. بر اساس توالی نوکلئوتیدی ژن F، ۸ جفت پرایمر ( H–A ) برای آنالیز HRM طراحی و ساخته شدند. در مرحله نخست ۲ ویروس واکسن و یک ویروس حاد با هر ۸ جفت پرایمر آنالیز شدند. بر اساس نتایج حاصله، در مرحله بعد ۳ جفت پرایمر از بین آنها انتخاب و تمام ویروسها مورد بررسی قرار گرفتند. با استفاده از نرم افزار، الگوهای بدست آمده از ویروس های وحشی با الگوهای حاصل از واکسن مقایسه شدند. با استفاده از جفت پرایمرهای A، B، C، F و H دمای ذوب سویه های واکسن بالاتر از جدایه های حاد به دست آمد، اما با پرایمرهای D، E و G این حالت دیده نشد. بر اساس آنالیز منحنی های HRM در این مطالعه، جفت پرایمرهای B و H توانستند بهتر از سایرجفت پرایمرها سویه های واکسن را از یکدیگر و از جدایه حاد تفکیک کنند. براساس یافته های حاصل از این مطالعه می توان نتیجه گرفت که با استفاده از آنالیز HRM و انتخاب پرایمرهای مناسب می توان در مدت زمان کوتاه و با دقت بالا در مقایسه با سایر روش های رایج قبلی نظیر انجام آزمایش های تعیین شاخص های بیماری زایی، آزمون RT-PCR و تعیین توالی نوکلئوتیدی اقدام به تفکیک و تعیین حدت ویروس های نیوکاسل و تشخیص ویروس های حاد از ویروس های واکسن کردکلیدواژه ها
آنالیز HRM, ویروس بیماری نیوکاسل, ویروس واکسن, تفکیک, پرایمراطلاعات بیشتر در مورد COI
COI مخفف عبارت CIVILICA Object Identifier به معنی شناسه سیویلیکا برای اسناد است. COI کدی است که مطابق محل انتشار، به مقالات کنفرانسها و ژورنالهای داخل کشور به هنگام نمایه سازی بر روی پایگاه استنادی سیویلیکا اختصاص می یابد.
کد COI به مفهوم کد ملی اسناد نمایه شده در سیویلیکا است و کدی یکتا و ثابت است و به همین دلیل همواره قابلیت استناد و پیگیری دارد.