جهت scaF بررسی بیوانفورماتیکی و آزمایشگاهی ژن جدید شناسایی ایزوله های استافیلوکوکوس اورئوس
- سال انتشار: 1393
- محل انتشار: مجله دانشگاه علوم پزشکی مازندران، دوره: 24، شماره: 116
- کد COI اختصاصی: JR_JMUMS-24-116_006
- زبان مقاله: فارسی
- تعداد مشاهده: 72
نویسندگان
Department of Pathobiology, School of Public Health, Tehran University of Medical Sciences, Tehran, Iran
Department of Pathobiology, School of Public Health, Tehran University of Medical Sciences, Tehran, Iran
Department of Bioscience and Biotechnology, Malekashtar University of Technology, Tehran, Iran
Department of Infectious Diseases, Sina Hospital, Tehran University of Medical Sciences, Tehran, Iran
Urology Research Center, Tehran University of Medical Sciences, Tehran, Iran
چکیده
سابقه و هدف : با توجه به تنوع ژنومی گونه ها و سویه های استافیلوکوکوس، تشخیص سریع باکتری استافیلوکوکوس اورئوس در نمونه های بالینی برای کاهش انتقال و گسترش این پاتوژن امری ضروری است. یکی از را ه های تشخیص سریع، انتخاب یکی از ژن های آن جهت شناسایی است . هدف از این مطالعه، شناسایی ایزوله های استافیلوکوکوس اورئوس با می باشد. scaF استفاده از ژن مواد و روش ها : این مطالعه در سال ۱۳۹۲ روی ۴۵ ایزوله استافیلوکوکوس اورئوس جدا شده از نمونه های بالینی با کمک نرم افزارهای وب مورد بررسی قرار scaF بیمارستان های دانشگاه علوم پزشکی تهران انجام گرفت . ابتدا ژن گرفت. در ادامه با کمک روش های بیوشیمیایی و آزمون های تشخیصی، ایزوله های استافیلوکوکوس اورئوس مورد تائید با واکنش زنجیره ای پلیمراز و پرایمرهای اختصاصی در این ایزول ه ها scaF ژنومی، ژن DNA قرار گرفتند . متعاقب استخراج توسط روش ژل الکتروفورز مورد بررسی قرار گرفتند. polymerase chainreaction(PCR) تکثیر یافت. نتایج حاصل از مثبت گردید . بررسی بیوانفورماتیک نشان داد که این ژن، ،scaF یافته ها : در همه ایزوله های مورد مطالعه وجود ژن ۶می باشد . / پروتئینی به وزن مولکولی ۳۳ کیلودالتون را کد کرده که دارای ۲۹۷ اسیدآمینه است و نقطه ایزوالکتریک آن ۳ تاکنون این پروتئین مورد بررسی آزمایشگاهی قرار نگرفته است. بوده که در سویه های Staphylococcal conserved antigens متعلق به خانواده ژنی scaF استنتاج: ژن حفاظت شده می باشد. علاوه بر این، به علت عدم وجود ژن ،JCVI استافیلوکوکوس اورئوس ثبت شده در پایگاه اطلاعاتی مشابه در استافیلوکوکوس اپیدرمیدیس و سایر گونه ها می توان از آن برای تشخیص استافیلوکوکوس اورئوس در عفون تها استفاده کرد.کلیدواژه ها
Staphylococcus aureus, polymerase chain reaction, detection, scaF, scaF, (PCR), استافیلوکوکوس اورئوس, واکنش زنجیره ای پلیمرازاطلاعات بیشتر در مورد COI
COI مخفف عبارت CIVILICA Object Identifier به معنی شناسه سیویلیکا برای اسناد است. COI کدی است که مطابق محل انتشار، به مقالات کنفرانسها و ژورنالهای داخل کشور به هنگام نمایه سازی بر روی پایگاه استنادی سیویلیکا اختصاص می یابد.
کد COI به مفهوم کد ملی اسناد نمایه شده در سیویلیکا است و کدی یکتا و ثابت است و به همین دلیل همواره قابلیت استناد و پیگیری دارد.