بررسی خوشه های پروتئینی در بیماری آتروفی عضلانی با استفاده از آنالیز شبکه تعامل
- سال انتشار: 1398
- محل انتشار: مجله دانشگاه علوم پزشکی مازندران، دوره: 29، شماره: 173
- کد COI اختصاصی: JR_JMUMS-29-173_001
- زبان مقاله: فارسی
- تعداد مشاهده: 52
نویسندگان
Professor, Proteomics Research Center, Faculty of Paramedical Sciences, Shahid Beheshti University of Medical Sciences, Tehran, Iran
Professor, Physiotherapy Research Centre, School of Rehabilitation, Shahid Beheshti University of Medical Sciences, Tehran, Iran
PhD in Applied Proteomics, Proteomics Research Center, Shahid Beheshti University of Medical Sciences, Tehran, Iran
چکیده
سابقه و هدف: یکی از بیماری های شایع ناشی از ابتلا به بسیاری از بیماری ها و کهولت سن، آتروفی عضلانی است. بررسی اتفاقات مولکولی موثر در ایجاد بیماری می تواند اطلاعات مفیدی در خصوص ارتقا روش های درمانی و حمایتی از بیماران فراهم نماید. این مطالعه با هدف بررسی تغییرات مولکولی در سطح ارتباطات پروتئینی با ترسیم و آنالیز شبکه تعامل پروتئینی بیماری اتروفی عضلانی، انجام پذیرفت. مواد و روش ها: در این مطالعه تجربی، با استفاده از نرم افزار Cytoscape و منبع STRINGشبکه برهم کنش پروتئین ها رسم و به کمک الگوریتم های وابسته به Cytoscape آنالیز شاخص های مرکزیت و خوشه های پروتئینی به کمک Network analyzer و MCODE انجام گردید. هستی شناسی کمپلکس های شبکه به کمک نرم افزار Bingo بررسی شد. یافته ها: تعداد ۵ پروتئین مرکزی شامل AKT۱، ALB، DMD، SMN۱و SMN۲ در شبکه شناسایی، و ۶ خوشه پروتئینی که ۲ خوشه اول آن ها برای آنالیز هستی شناسی در نظر گرفته شد معرفی گردید. استنتاج: کلیه پروتئین های مهم در این خوشه ها به صورت پراکنده وجود داشتند. به نظر می رسد که پانل بیومارکری معرفی شده شامل AKT۱، ALB، DMD، SMN۱و SMN۲ می تواند در درک بهتر بیماری موثر باشد.کلیدواژه ها
atrophy, protein interaction maps, protein clusters, biomarkers, آتروفی, شبکه برهم کنش پروتئینی, خوشه های پروتئینی, بیوماکرهااطلاعات بیشتر در مورد COI
COI مخفف عبارت CIVILICA Object Identifier به معنی شناسه سیویلیکا برای اسناد است. COI کدی است که مطابق محل انتشار، به مقالات کنفرانسها و ژورنالهای داخل کشور به هنگام نمایه سازی بر روی پایگاه استنادی سیویلیکا اختصاص می یابد.
کد COI به مفهوم کد ملی اسناد نمایه شده در سیویلیکا است و کدی یکتا و ثابت است و به همین دلیل همواره قابلیت استناد و پیگیری دارد.