مطالعه ی بیوانفورماتیکی و تجربی بیان ژن های UBE۲Wو SSX۲IP در سلول های سرطانی HepG۲ تیمار شده با ملاتونین
- سال انتشار: 1399
- محل انتشار: مجله دانشگاه علوم پزشکی مازندران، دوره: 30، شماره: 192
- کد COI اختصاصی: JR_JMUMS-30-192_002
- زبان مقاله: فارسی
- تعداد مشاهده: 201
نویسندگان
PhD Student in Genetics, Faculty of Natural Sciences, University of Tabriz, Tabriz, Iran
MSc in Genetics, Faculty of Natural Sciences, University of Tabriz, Tabriz, Iran
MSc in Animal Physiology, Faculty of Natural Sciences, University of Tabriz, Tabriz, Iran
Associate Professor, Department of Animal Biology, Faculty of Natural Sciences, University of Tabriz, Tabriz, Iran
چکیده
سابقه و اهداف: هدف از مطالعه حاضر ارزیابی بیوانفورماتیکی و تجربی تاثیر ملاتونین بر بیان ژنهای UBE۲W و SSX۲IP در رده سلولی HepG۲ تیمار شده با داروی ملاتونین میباشد. UBE۲W پروتئینی را رمزگذاری می کند که باعث افزایش یوبیکویتینه شدن پروتئینهای گروه مکمل آنمی فانکونی شده و ممکن است در ترمیم آسیب DNA مهم باشد. SSX۲IP متعلق به سیستم اتصال سلولی است که در حرکت سلول دخیل است و به عنوان یک عامل بلوغ سانتروزوم عمل می کند. مواد و روشها: در ابتدا، نرم افزار MATLAB ۲۰۱۸a برای ارزیابی میزان بیان ژنهای UBE۲W و SSX۲IP از دادههای میکرو آرایه مورد استفاده قرار گرفت. سپس، بعد از طراحی و تهیه پرایمرها، آزمایشات تجربی شامل تست MTT و Real-time PCR انجام گرفت. یافته ها: نتیجه تست MTT نشان داد که زنده مانی سلول مورد مطالعه در گروه تیمار شده با ملاتونین بصورت معنی داری کاهش می یابد و میزان IC۵۰ برای ۴۸ ساعت برابر ۴۵۰ میکرومولار تخمین زده شد. نتایج Real-time PCR ثابت کرد که میزان بیان هر دو ژن مورد مطالعه در سلولهای تیمار شده با ملاتونین در مقایسه با گروه شاهد افزایش ( غیر معنیدار p≥ ۰.۰۵ در ۲۴ ساعت و معنیدار p≤۰.۰۵ در ۴۸ ساعت) می یابد که هم راستا با نتایج آنالیز بیوانفورماتیکی میباشد. استنتاج: نتایج این مطالعه نشان میدهد که UBE۲W و SSX۲IP میتوانند به عنوان ژن هدف در درمان هپاتوسلولار کارسینوما به کار گرفته شود، اگر چه برای تایید این نتایج نیاز به انجام مطالعات گسترده میباشد.کلیدواژه ها
melatonin, Hepatocellular carcinoma, bioinformatics, microarray data, ملاتونین, کارسینومای هپاتوسلولار, بیوانفورماتیک, داده های میکرو آرایهاطلاعات بیشتر در مورد COI
COI مخفف عبارت CIVILICA Object Identifier به معنی شناسه سیویلیکا برای اسناد است. COI کدی است که مطابق محل انتشار، به مقالات کنفرانسها و ژورنالهای داخل کشور به هنگام نمایه سازی بر روی پایگاه استنادی سیویلیکا اختصاص می یابد.
کد COI به مفهوم کد ملی اسناد نمایه شده در سیویلیکا است و کدی یکتا و ثابت است و به همین دلیل همواره قابلیت استناد و پیگیری دارد.