بررسی ساختار ژنتیکی اسب نژاد عرب با استفاده از نشانگرهای ریزماهواره
- سال انتشار: 1402
- محل انتشار: مجله تحقیقات تولیدات دامی، دوره: 12، شماره: 1
- کد COI اختصاصی: JR_ARGU-12-1_005
- زبان مقاله: فارسی
- تعداد مشاهده: 299
نویسندگان
دانشیار، بخش تحقیقات بیوتکنولوژی، موسسه تحقیقات علوم دامی کشور، سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی، کرج، ایران
استادیار، بخش تحقیقات علوم دامی، مرکز تحقیقات و آموزش کشاورزی و منابع طبیعی استان ایلام، سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی، ایلام، ایران
استادیار، بخش تحقیقات ژنتیک و اصلاح نژاد دام، موسسه تحقیقات علوم دامی کشور، سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی، کرج، ایران
استادیار، بخش تحقیقات ژنتیک و اصلاح نژاد دام، موسسه تحقیقات علوم دامی کشور، سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی، کرج، ایران
چکیده
هدف از این تحقیق، بررسی تنوع ژنتیکی اسبهای عرب ایران با استفاده از نشانگرهای ریزماهواره بود. به این منظور از تعداد ۱۰ نشانگر ریزماهواره شامل AHT۰۴، AHT۰۵، ASB۰۲، ASB۱۷، ASB۲۳، HMS۰۳، HMS۰۶، HMS۰۷ و VHL۲۰ مورد تایید انجمن بینالمللی ژنتیک دام استفاده شد. تعداد ۸۶۷۳ نمونه موی اسب از استانهای خوزستان، یزد، کرمان، اصفهان، لرستان و البرز جمع آوری شد و سپس استخراج DNA از نمونههای اخذ شده انجام گرفت. نشانگرهای ریزماهواره با روش Multiplex PCR تکثیر شدند. سپس محصولات تکثیر شده به وسیله سیستم Genetic analyzer و با روش الکتروفورز مویینه تعیین ژنوتیپ شدند. بیشترین و کمترین تعداد آلل مشاهده شده به ازای هر نشانگر، به ترتیب مربوط به نشانگرهای ASB۱۷ (۱۷ آلل)، HMS۰۶ (هشت آلل) و HMS۰۷ (هشت آلل) بودند. مجموع تعداد کل آللهای مشاهده شده در همه جایگاهها و میانگین تعداد آلل مشاهده شده به ترتیب برابر با ۱۱۳ و ۳/۱۱ بودند. میانگین تعداد آلل موثر، شاخص شانون، میزان هتروزیگوسیتی مشاهده شده و مورد انتظار و شاخص تثبت به ترتیب ۹۷/۳، ۵۸/۱، ۷۲۱/۰، ۷۳۶/۰ و ۰۲۱/۰ بهدست آمد. میانگین تنوع ژنتیکی در جمعیت اسب عرب مورد بررسی برابر با ۷۳۶/۰ محاسبه شد. بیشترین تنوع ژنتیکی در نشانگر VHL۲۰ با فراوانی برابر با ۸۰۳/۰ و کمترین میزان تنوع ژنتیکی مربوط به نشانگر ASB۲ با مقدار ۶۲۰/۰ بود. فراسنجههای جمعیتی در اسب عرب نشان داد که چندشکلی و تنوع ژنتیکی در این نژاد نسبتا بالا است. وجود تنوع ژنتیکی در این نژاد جهت اجرای برنامههای اصلاحی و حفاظت نژادی از اهمیت ویژهای برخوردار است.کلیدواژه ها
اسب عرب, تنوع ژنتیکی, فراسنجه های جمعیتی, نشانگر ریزماهوارهاطلاعات بیشتر در مورد COI
COI مخفف عبارت CIVILICA Object Identifier به معنی شناسه سیویلیکا برای اسناد است. COI کدی است که مطابق محل انتشار، به مقالات کنفرانسها و ژورنالهای داخل کشور به هنگام نمایه سازی بر روی پایگاه استنادی سیویلیکا اختصاص می یابد.
کد COI به مفهوم کد ملی اسناد نمایه شده در سیویلیکا است و کدی یکتا و ثابت است و به همین دلیل همواره قابلیت استناد و پیگیری دارد.