استفاده از تعاملات پروتئینها در بازسازی شبکههای تنظیمکنندهی ژنی با استفاده از شبکهی بیزین و دادههای بیان ژن میکروآرایه
- سال انتشار: 1387
- محل انتشار: پانزدهمین کنفرانس مهندسی پزشکی ایران
- کد COI اختصاصی: ICBME15_087
- زبان مقاله: فارسی
- تعداد مشاهده: 969
نویسندگان
دانشکده مهندسی پزشکی دانشگاه صنعتی امیرکبیر
دانشکده مهندسی پزشکی، دانشگاه صنعتی امیرکبیر
دانشکده مهندسی پزشکی دانشگاه صنعتی امیرکبیر
دانشکده مهندسی پزشکی دانشگاه صنعتی امیرکبیر
چکیده
شبکهی تنظیمکنندهی ژنی مجموعهای از ژنها میباشند که با هم و با مواد دیگر در سلول تعامل دارند و به این وسیله نرخ رونویسی ژن ها به mRNA را کنترل می کنند. با مدلسازی این شبکه ها، می توان عملکرد سلولی را در سطح مولکولی تحلیل نمود. روش آزمایشگاهی میکروآرایه های DNA امکان اندازه گیری همزمان بیان هزاران ژن را فراهم می کند. به منظور مدلسازی شبکه های ژنی از دادههای میکروآرایه از تکنیکهای مختلفی استفاده شده است. با این وجود استفاده از فقط دادههای میکروآرایه برای تخمین صحیحاین شبکهها کافی نیست؛ لذا روشهائی برای استفاده از انواع دیگر اطلاعات بیولوژیکی به همراه دادههای میکروآرایه به منظور بهبودنتایج مدلسازی ارائه شدهاند. در این مقاله، از ترکیب دادههای میکروآرایه و تعاملات پروتئینی برای بازسازی شبکههای ژنتیکی به کمکشبکهی بیزین استفاده شده است؛ به این صورت که برای ارتباطات با و بدون تعاملات پروتئینی در شبکه، سطوح انرژی متفاوتی در نظر گرفته می شود. نتایج به دست آمده بر روی داده های سری زمانی مربوط به چرخه ی سلولی مخمر (Yeast) نشان می دهند که روش ارائه شده، توانائی شبکه ی بیزین را در تشخیص روابط درست به حد قابل توجهی بهبود میدهد (افزایش صحت از % 62 به % 76).کلیدواژه ها
تعاملات پروتئینی، دادههای سریزمانی میکروآرایه، شبکهی بیزین، شبکههای تنظیمکنندی ژنتیکیاطلاعات بیشتر در مورد COI
COI مخفف عبارت CIVILICA Object Identifier به معنی شناسه سیویلیکا برای اسناد است. COI کدی است که مطابق محل انتشار، به مقالات کنفرانسها و ژورنالهای داخل کشور به هنگام نمایه سازی بر روی پایگاه استنادی سیویلیکا اختصاص می یابد.
کد COI به مفهوم کد ملی اسناد نمایه شده در سیویلیکا است و کدی یکتا و ثابت است و به همین دلیل همواره قابلیت استناد و پیگیری دارد.