Evaluating the prevalence of Antibiotic resistance,ESBL genes, integrons, phylogenetic groups andMLVA profiles of Escherichia coli pathotypesisolated from patients with diarrhea and farmanimals in south-east of Iran
- سال انتشار: 1402
- محل انتشار: هفتمین کنفرانس بین المللی پژوهش های کاربردی در علوم و مهندسی
- کد COI اختصاصی: CARSE07_261
- زبان مقاله: انگلیسی
- تعداد مشاهده: 170
نویسندگان
Department of Microbiology and Virology, Kerman University of Medical Sciences, Kerman,Iran
Seyed Mohammad Ghorbani Dazmiri
Faculty of Biological Sciences, Sari Branch, Islamic Azad University, Sari, Iran
Department of Microbiology, Faculty of Biological Sciences, Alzahra University, Tehran ,Iran
Department of Microbiology, Faculty of Convergent Sciences and Technologies, Science &Research Branch, Islamic Azad University, Tehran, Iran
Department of Medical Microbiology, Faculty of Medicine, Shahrekord University of MedicalSciences, Shahrekord, Iran
Young Researchers and Elite Club, Darab Branch, Islamic Azad University, Darab, Fars, Iran
چکیده
The aims of this study were to investigate the prevalence, antibiotic resistance, presence ofclass ۱ and ۲ in- tegrons, EXtended Spectrum β-Lactamases (ESBL) genes, phylogeneticgroup and epidemiological relationships of EPEC, ETEC and EHEC pathotypes isolated frompatients with diarrhea and farm animals in south east region of Iran. A total of ۶۷۱diarrheagenic E. coli (DEC) were collected from stool samples of ۳۹۵ patients with diarrheaand ۲۷۶ farm cattles and goats. Presence of EPEC, ETEC and EHEC were identified usingmultiplex-PCR em- ploying primers targeted the shiga toXin (stx), intimin (eae), bundle formingpili (bfp), and enterotoXins (lt and st) genes. The highest proportion of the patients (۶۴%) werechildren under age ۱–۱۵ year (p ≤ ۰.۰۵). Among the isolates, atypical EPEC was detected in۲۶ patients and ۱۴ animal stool samples, while typical EPEC was found in ۲ cattles. ETECisolates were detected in stools of ۱۳ patients and ۴ EHEC was identified in ۳ goats and onecattle. The isolates were checked for susceptibility to ۱۴ antibiotics. ۵۰% (n = ۱۳) of EPECand ۶۱.۵% (n =۸) of ETEC showed multi-drug resistance (MDR) profiles and one EPEC wasfound to be extensive drug resistant (XDR). In contrast, EHEC isolates were susceptible to the majority of antimicrobial agents. The MDR isolates were positive for blaTEM and blaCTX-MESBL genes and carried class ۱ integrons. Further study on the biofilm formation indicatedthat, ۳ out of ۴ EHEC isolates showed strong biofilm, while other pathotypes had eithermoderate, weak or no biofilm activity. Majority of EPEC isolates were belonged to phylogeneticgroup B۱, all except one ETEC were classified as phylogenetic group A and two EHEC werebelonged to phylogroup D, respectively. A multilocus variable tandem repeat analysis (MLVA)exhibited ۲۲ distinct patterns. In conclusion, MLVA data showed high clonal diversity.Presence of EHEC in animal origins pose public health concern in this region.کلیدواژه ها
Antibiotic resistance, ESBL genes, Escherichia coliمقالات مرتبط جدید
- بررسی عملکرد لرزه ای سازه های بتنی در مقابل حوادث طبیعی همچون زلزله
- بررسی جایگاه هوش مصنوعی در موفقیت مهندسی عمران
- نقش و جایگاه عمران و شهرسازی در ایجاد و توسعه گردشگری شهرهای شمالی
- واکاوی ویژگی های محیط های معماری و شهرسازی در دوران همه گیری ویروس کرونا
- بررسی ویژگی های شهر دوستدارکودک از منظر طراحی فضاهای شهری
اطلاعات بیشتر در مورد COI
COI مخفف عبارت CIVILICA Object Identifier به معنی شناسه سیویلیکا برای اسناد است. COI کدی است که مطابق محل انتشار، به مقالات کنفرانسها و ژورنالهای داخل کشور به هنگام نمایه سازی بر روی پایگاه استنادی سیویلیکا اختصاص می یابد.
کد COI به مفهوم کد ملی اسناد نمایه شده در سیویلیکا است و کدی یکتا و ثابت است و به همین دلیل همواره قابلیت استناد و پیگیری دارد.