بررسی تنوع ژنتیکی ژنوتیپ های سیب بومی سیستان با استفاده از نشانگرهای IRAP وREMP
عنوان مقاله: بررسی تنوع ژنتیکی ژنوتیپ های سیب بومی سیستان با استفاده از نشانگرهای IRAP وREMP
شناسه ملی مقاله: JR_RIP-7-1_002
منتشر شده در در سال 1401
شناسه ملی مقاله: JR_RIP-7-1_002
منتشر شده در در سال 1401
مشخصات نویسندگان مقاله:
مجتبی شهرکی - دانش آموخته کارشناسی ارشد گیاهان دارویی، گروه باغبانی و فضای سبز، دانشکده کشاورزی، دانشگاه زابل، زابل، ایران.
نفیسه مهدی نژاد - استادیار گروه اصلاح نباتات و بیوتکنولوژی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه زابل، زابل، ایران.
براتعلی فاخری - استاد گروه اصلاح نباتات و بیوتکنولوژی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه زابل، زابل، ایران.
لیلا فهمیده - دانشیار گروه اصلاح نباتات و بیوتکنولوژی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه زابل، زابل، ایران.
مهدی آران - استادیار گروه باغبانی و فضای سبز، دانشکده کشاورزی، دانشگاه زابل، زابل، ایران.
خلاصه مقاله:
مجتبی شهرکی - دانش آموخته کارشناسی ارشد گیاهان دارویی، گروه باغبانی و فضای سبز، دانشکده کشاورزی، دانشگاه زابل، زابل، ایران.
نفیسه مهدی نژاد - استادیار گروه اصلاح نباتات و بیوتکنولوژی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه زابل، زابل، ایران.
براتعلی فاخری - استاد گروه اصلاح نباتات و بیوتکنولوژی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه زابل، زابل، ایران.
لیلا فهمیده - دانشیار گروه اصلاح نباتات و بیوتکنولوژی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه زابل، زابل، ایران.
مهدی آران - استادیار گروه باغبانی و فضای سبز، دانشکده کشاورزی، دانشگاه زابل، زابل، ایران.
به منظور بررسی تنوع ژنتیکی ۲۵ ژنوتیپ سیب از سه منطقه هامون، بنجار و امامیه شهرستان زابل و یک منطقه زاهدان، از ۱۱ آغازگر IRAP و ۳ آغازگر REMAP استفاده شد. ۱۴ آغازگر مورد استفاده در مجموع توانستند ۶۱ مکان ژنی چند شکل را شناسایی کنند. بر اساس نتایج به دست آمده، میانگین درصد چندشکلی در بین ژنوتیپ های مطالعه شده برابر ۷۹/۳۹ درصد بود که کمترین درصد چندشکلی به آغازگر ۸۳۰۰۳+K۰۰۱ و بیشترین درصد چندشکلی به آغازگر ۸۵۶۵ اختصاص داشت. محتوای اطلاعات چندشکلی (PIC) نشانگرها بین ۰۲/۰تا ۲۸/۰ و شاخص نشانگر (MI) بین ۲۹/۰ تا ۵۴/۰ در کل ژنوتیپ های مورد مطالعه متغیر بود. بیشترین میزان PIC مربوط به آغازگر K۰۰۶ و کمترین میزان PIC مربوط به نشانگرهای ۸۳۰۰۳+K۰۰۱ بود. همچنین بیشترین میزان MI مربوط به ۸۵۶۵ و کمترین میزان MI مربوط به آغازگر ۸۳۰۰۳+K۰۰۱ بود. نتایج حاصل این احتمال را تقویت کرد که رتروترانسپوزون هایی که بیشترین چند شکلی را تولید نموده اند، در تکامل گیاهان مورد تحقیق بیشتر جابجا شده و تعداد نسخه های بیشتری را داخل ژنوم تکثیر کرده اند. نتایج تجزیه خوشه ای بر اساس روش۲۵UPGMA ژنوتیپ مورد مطالعه را در سه گروه مجزا قرار داد. ژنوتیپ های با منشا جغرافیایی و همچنین شباهت های مورفولوژیکی و صفات باغبانی یکسان در زیر گروه های متفاوت قرار گرفتند که علت این دسته بندی می تواند به دلیل میزان متفاوت عناصر متحرک موجود در این ژنوتیپ ها باشد.
کلمات کلیدی: چند شکلی, رتروترنسپوزون, ژنوم, شاخص نشانگر, مکان ژن
صفحه اختصاصی مقاله و دریافت فایل کامل: https://civilica.com/doc/1678180/