بررسی تنوع ژنتیکی و شناسایی نشانه های ردپای انتخاب در چهار نژاد اصلی اسب ایرانی
- سال انتشار: 1402
- محل انتشار: فصلنامه بیوتکنولوژی کشاورزی، دوره: 15، شماره: 2
- کد COI اختصاصی: JR_JOAGK-15-2_002
- زبان مقاله: فارسی
- تعداد مشاهده: 209
نویسندگان
دانشجوی دکتری، گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه کردستان، سنندج، ایران
گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه کردستان، سنندج، ایران.
گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی دانشگاه کردستان، سنندج
موسسه تحقیقات علوم دامی کشور، کرج، ایران
چکیده
هدف: انتخابهای طبیعی و مصنوعی باعث تغییر در فراوانی آللی در بین جمعیتها شده و به صورت مداوم الگوهای قابل شناسایی را بر روی سطح ژنوم طی فرآیند اهلیسازی برجای میگذارند. اطلاعات کمی در خصوص تفاوتهای ساختارهای ژنتیکی در نژادهای اسب بومی ایران که منتج از فشارهای انتخابی هستند وجود دارد. بنابراین، در این مطالعه با استفاده از اطلاعات چهار نژاد اسب بومی شامل ترکمن (۲۹ نمونه)، کاسپین (۲۱ نمونه)، کرد (۶۷ نمونه) و اصیل ایرانی (۵۲ نمونه) به بررسی تنوع ژنتیکی پرداخته شد. مواد و روش ها: برای این منظور سه روش تجزیه مولفه های اصلی (PCA)، پیوستگی مجاور (NJ) و اختلاط جمعیتی مورد بررسی قرار گرفت. در ادامه با کمک ادغام سه روش مختلف شناسایی نشانههای انتخاب شامل TajimaD، تنوع نوکلئوتیدی (pi) و درجه هاپلوتایپی یکپارچه (iHS) اقدام به شناسایی ردپاهای انتخاب در این نژادها گردید. برای ادغام نتایج مختلف این سه روش، از چهارچوب ترکیب همبسته سیگنال های چند گانه استفاده گردید. نتایج: تمام روش های مورد استفاده برای بررسی ساختار ژنتیکی، به خوبی این چهار نژاد را از هم جدا نموده و یک الگوی مرتبط با منشاء جغرافیایی را برای تنوع ژنتیکی آنها نشان داد. با ترکیب روشهای مختلف شناسایی نشانههای انتخاب، تعداد زیادی از ژنهای تحت تاثیر فشار انتخاب در هر چهار نژاد شناسایی گردید. این ژنها با مسیرهای خاص GO و نواحی مرتبط با QTL در ارتباط بودند. تعداد ۱۶ ژن مشترک در بین چهار نژاد به عنوان ژن های کاندید انتخاب شناسایی گردید. بعلاوه، در هر چهار نژاد تحت بررسی تعداد ۱۱ نوع QTL مشترک شناسایی گردید که به دسته صفات مرتبط با سازگاری، شایستگی از طریق نقصهای ژنتیکی و یا رفتاری و ظاهری قابل تقسیم بودند. نتیجه گیری: در مجموع نتایج بدست آمده در این تحقیق می تواند در درک بهتر فرآیند انتخاب طبیعی و مصنوعی در اسبهای ایران کمک نماید. همچنین این تحقیق به درک بهتر تفاوتهای ژنتیکی بین نژادهای اسب بومی ایران کمک نموده که می تواند در یافتن بهترین راه حل برای حفظ و بهبود تنوع ژنتیکی کمک شایانی نماید.کلیدواژه ها
نشانه های انتخاب, اسب اصیل, اسب کاسپین, اسب ترکمن, اسب کرداطلاعات بیشتر در مورد COI
COI مخفف عبارت CIVILICA Object Identifier به معنی شناسه سیویلیکا برای اسناد است. COI کدی است که مطابق محل انتشار، به مقالات کنفرانسها و ژورنالهای داخل کشور به هنگام نمایه سازی بر روی پایگاه استنادی سیویلیکا اختصاص می یابد.
کد COI به مفهوم کد ملی اسناد نمایه شده در سیویلیکا است و کدی یکتا و ثابت است و به همین دلیل همواره قابلیت استناد و پیگیری دارد.