بررسی بیوانفورماتیکی خاصیت ضد ویروسی فلاونوئید گیاهی Rhamnetin به منظور مهار پروتئاز ویروس HIV
- سال انتشار: 1401
- محل انتشار: اولین کنفرانس بین المللی زیست شناسی گیاهان دارویی
- کد COI اختصاصی: BIOMED01_292
- زبان مقاله: فارسی
- تعداد مشاهده: 191
نویسندگان
دانشجو ی زیست فناوری، گروه زیست شناسی، دانشکده علوم، موسسه آموزش عالی زند شیراز، شیراز، فارس، ایران
دکتری بیوشیمی، گروه زیست شناسی، دانشکده علوم، موسسه آموزش عالی زند شیراز، شیراز، فارس، ایران
دکتری بیوشیمی،گروه زیست شناسی، دانشکده علوم پایه، موسسه آموزش عالی نور دانش، میمه، اصفهان، ایران
چکیده
مقدمه : ویروس HIV برای عفونت زایی نیاز به فعالیت پروتئازی آنزیم شبیه به پپسین دارد بنابراین در اکثر موارد به منظورکنترل این ویروس مهار کننده های پروتئاز HIV مورد هدف قرار داده می شود. با توجه به اهمیت عملکرد این آنزیم ، هدف این مطالعه بررسی اثر مهارکنندگی ترکیب گیاهی Rhmnetin بر فعالیت پروتئاز HIV به روش داکینگ مولکولی می باشد.روشها: در این مطالعه ، برای بررسی نحوه اتصال ترکیبات به جایگاه فعال آنزیم ، ترسیم ساختار شیمیایی ترکیبات، بهینه سازی انرژی، مطالعات داکینگ و تجزیه و تحلیل های نهایی به ترتیب از نرم افزارهای ChemDraw، Hyoerchwm،AutoDockTools، DS Visualizer و Lig plot استفاده شد.یافته ها: ترکیب مورد مطالعه قادر به اشغال جایگاه فعال پروتئاز HIV، با سطح انرژی kcal/mol ۹۵.۴- بوده و تمایل زیادی برای اتصال به آمینواسیدهای کلیدی جایگاه فعال آنزیم دارد و با آمینواسید های ۵۰A:Ily، ۴۸A:Gly، ۳۰A:Asp، ۴۹B:Gly پیوند هیدروژنی برقرار می کند که پیوند هیدروژنی ۳۰A:Asp با لیگاند، مشابه پیوند هیدوژنی کوکریستال است .نتیجه گیری: با در نظر گرفتن این که ترکیب مورد مطالعه در بررسی های داکینگ مولکولی ، قادر به اتصال به جایگاه فعال پروتئاز ویروس HIV هست ، می توان برای بررسی های تکمیلی ، اثر این ترکیب را شرایط آزمایشگاهی مورد بررسی و آنالیز قرار داد.کلیدواژه ها
Human Immunodeficiency Virus (HIV)، مهارکننده Rhmnetin، داکینگ مولکولی ، پیوند هیدروژنیمقالات مرتبط جدید
- بررسی تنوع زیستی گیاهان مرتعی ارتفاعات کبیرکوه در جنوب دره شهر (استان ایلام)
- عوامل موثر بر میزان پیچان رودخانه های خرم اباد
- ارزیابی کیفیت آب شرب گاوهای شیری در گاوداری های صنعتی حومه مشهد از نظر وجود فلزات سنگین، نیترات و سولفات
- بیو پلیمر پلی ساکاریدی برای مصارف دامپزشکی
- راهکارهای کارآمد کاهش انتشار گازهای گلخانه ای از طریق فناوری کشاورزی هوشمند
اطلاعات بیشتر در مورد COI
COI مخفف عبارت CIVILICA Object Identifier به معنی شناسه سیویلیکا برای اسناد است. COI کدی است که مطابق محل انتشار، به مقالات کنفرانسها و ژورنالهای داخل کشور به هنگام نمایه سازی بر روی پایگاه استنادی سیویلیکا اختصاص می یابد.
کد COI به مفهوم کد ملی اسناد نمایه شده در سیویلیکا است و کدی یکتا و ثابت است و به همین دلیل همواره قابلیت استناد و پیگیری دارد.