همسانه سازی و بررسی ویژگی های ساختاری ژن کنترل کننده گلدهی AGL۶ در سیر گلده ایرانی

سال انتشار: 1401
محل انتشار: اولین کنفرانس بین المللی زیست شناسی گیاهان دارویی
کد COI اختصاصی: BIOMED01_204
زبان مقاله: فارسی
تعداد مشاهده: 78

نویسندگان

گروه علوم باغبانی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه بوعلی سینا، همدان

چکیده

اکثر ارقام تجاری سیر غیر گلده و عقیم می باشند. درک صحیح از ساختار ژن AGL۶ به عنوان یک ژن کنترلکننده گلدهی و باروری در انواع گلده و زایای سیر، روند برنامه های اصلاحی این گیاه دارویی با ارزش را بهبود می بخشد. بدین منظور ابتدا بیان نسبی این ژن در اندامهای مختلف سیر با استفاده RT-PCR بررسی شد. سپس بخشی از ژن AGL۶ با استفاده از تکنیک RT-PCR از گلچه های سیر ایرانی جداسازی و همسانه سازی شد. نتایج حاصل از توالی یابی پلاسمید نوترکیب با استفاده از نرم افزار Vector NTI و ORF finder مورد بررسی قرار گرفت . در نهایت توالی نوکلئوتیدی و پروتئینی به دست آمده در این تحقیق با نرم افزار بلاست واقع در وب سایت NCBI هم ردیف و ویژگی های ساختاری آن مشخص گردید. بر اساس نتایج به دست آمده قطعه همسانه سازی شده کدکننده ژن AsAGL۶ به طول ۷۲۸ جفت باز می باشد. بررسی توالی آمینواسیدی و موتیف های ساختاری ژن AsAGL۶ نشان داد که این توالی نوکلئوتیدی یک پروتئین با ۲۴۳ اسید آمینه را کد می کند به طوریکه نوکلئوتید۷ تا ۱۹۷ کد کننده دومین MADS-box و نوکلئوتید ۲۴۳ تا ۵۰۹ کد کننده دومین K-box می باشند. بلاست توالی نوکلئوتیدیژ پروتئینی توالی حاضر نیز تشابه بالای ۹۰ درصد را با توالی مربوط به ژن AGL۶ در سایر گیاهان تک لپه ای نظیر پیاز، لیلیوم و گل نرگس نشان داد.

کلیدواژه ها

AGAMOUS- Like ۶، Allium sativum، باروری

مقالات مرتبط جدید

اطلاعات بیشتر در مورد COI

COI مخفف عبارت CIVILICA Object Identifier به معنی شناسه سیویلیکا برای اسناد است. COI کدی است که مطابق محل انتشار، به مقالات کنفرانسها و ژورنالهای داخل کشور به هنگام نمایه سازی بر روی پایگاه استنادی سیویلیکا اختصاص می یابد.

کد COI به مفهوم کد ملی اسناد نمایه شده در سیویلیکا است و کدی یکتا و ثابت است و به همین دلیل همواره قابلیت استناد و پیگیری دارد.