بررسی شناسایی پروتئینهای ضروری با استفاده از الگوریتم بهبود یافته جستجوی موضوع القا شده با ابرپیوند
- سال انتشار: 1401
- محل انتشار: هشتمین کنفرانس بین المللی تحقیقات بین رشته ای در مهندسی برق، کامپیوتر، مکانیک و مکاترونیک در ایران و جهان اسلام
- کد COI اختصاصی: ECMM08_012
- زبان مقاله: فارسی
- تعداد مشاهده: 248
نویسندگان
دانش آموخته کارشناسی ارشد، دانشگاه سیستان و بلوچستا ن
چکیده
پروتئینهای ضروری برای رشد و سازماندهی سلول حیاتی هستند. بر همین اساس، تشخیص و تجزیه وتحلیل پروتئینهای ضروری برای درک مکانیسم های مولکول ی سلولهای زنده و طراحی داروهای جدید از اهیمت زیادی برخوردار است. با توسعه فنآوریهای با توان بالا، بسیاری از داده های تعامل پروتئین-پروتئین (PPI) در دسترس است که مطالعات پروتئینهای ضروری را در سطح شبکه تسهیل میکند. اگرچه روشهای مختلفی پیشنهاد شده اند اما به دلیل دقت پایین، این روشها نیاز به بهبود دارند. در این مقاله، به بررسی یک روش جدید با محوریت استفاده جستجوی موضوع القا شده با ابر پیوند (HITS) در شبکه ها ی پروتئین-پروتیئن وزندار برای شناسایی پروتئینهای ضروری، به نام HSEP، پرداخته میشود. ابتدا یک شبکه PPI بدون جهت به یک شبکه PPI جهتدار تبدیل میشود. سپس، هم اطلاعات بیولوژیکی و هم ویژگیها ی توپولوژیکی شبکه برای شبکه ها ی PPI وزندار در نظر گرفته میشوند. اطلاعات بیولوژیکی شامل داده های بیان ژن، حاشیه نویسی و محلی سازی درون سلولی است . ضریب خوشه بندی یال به عنوان ویژگ یهای توپولوژیکی شبکه PPI، برای اندازه گیری نزدیکی دو گره متصل مورد استفاده قرار می گیرد. در HSEPآزمایشهایی بر روی دو گونه به نامهای Saccharomyces cerevisiae وDrosophila melanogasterانجام شده است و نتایج تجربی نشان میدهد که HSEP از برخی تکنیکهای پیشرفته شناسایی پروتئینهای ضروری بهتر عمل میکند.کلیدواژه ها
پروتئینهای ضروری ، الگوریتم HITS، شبکه های PPI وزندارمقالات مرتبط جدید
- Emerging Trends and Applications of Machine Vision in Industrial Automation
- Experimental and numerical study on severe plastic deformation of pure copper using simple shear extrusion process
- بررسی اثر زبری سطح بر روی خستگی قطعات پلیمری تولید شده به روش پرینت سه بعدی
- Investigation of The PID Controller Gains Effect on Electronic Stability Program (ESP) Performance
- بررسی میزان باریک شدگی میدان کانال پیل سوختی و موانع حین حرکت جریان سمت کاتد در میزان و توزیع غلظت اکسیژن مرز کاتالیست
اطلاعات بیشتر در مورد COI
COI مخفف عبارت CIVILICA Object Identifier به معنی شناسه سیویلیکا برای اسناد است. COI کدی است که مطابق محل انتشار، به مقالات کنفرانسها و ژورنالهای داخل کشور به هنگام نمایه سازی بر روی پایگاه استنادی سیویلیکا اختصاص می یابد.
کد COI به مفهوم کد ملی اسناد نمایه شده در سیویلیکا است و کدی یکتا و ثابت است و به همین دلیل همواره قابلیت استناد و پیگیری دارد.