مطالعه ارتباطی در سطح ژنوم صفات گیاهچه ای در ارقام گندم نان تحت شرایط نرمال و تنش شوری
- سال انتشار: 1401
- محل انتشار: مجله پژوهش های ژنتیک گیاهی، دوره: 9، شماره: 1
- کد COI اختصاصی: JR_PGRLU-9-1_002
- زبان مقاله: فارسی
- تعداد مشاهده: 314
نویسندگان
Department of Plant Production and Genetics, Faculty of Agriculture, Urmia University, Urmia, Iran
Department of Plant Production and Genetics, Faculty of Agriculture, Urmia University, Urmia, Iran
Department of Plant Production and Genetics, Faculty of Agriculture, Urmia University, Urmia, Iran
چکیده
به منظور شناسایی مکان های ژنی کنترل کننده صفات مورفو-فیزیولوژیک گیاهچه در ۸۸ رقم گندم نان، آزمایشی در شرایط نرمال و تنش شوری ۱۲۰ میلی مولار (معادل ۱۲ دسی زیمنس بر متر)، در قالب طرح آلفا لاتیس ساده در گلخانه دانشکده کشاورزی دانشگاه ارومیه در سال زراعی ۱۴۰۰-۱۳۹۹ انجام شد. صفات میزان کلروفیل a، b و کل، کا روتنوئید، پرولین، وزن تر و خشک گیاهچه، طول گیاهچه، محتوای نسبی آب برگ (RWC) و غلظت یون ها (سدیم، پتاسیم و نسبت پتاسیم به سدیم) اندازه گیری شدند. پس از ژنوتیپ سنجی به وسیله توالی یابی با فناوری Ion Torrent و حذف SNPهایی با بیش از ۲۰ درصد داده گمشده و فراوانی آلل جزئی کمتر از ۵ درصد، تعداد ۵۸۶۹ SNP شناسایی شد. بر اساس نقشه یابی ارتباطی با روش مدل خطی مخلوط (MLM) برای شرایط نرمال در مجموع ۲۵ ارتباط نشانگر-صفت (MTA) شناسایی شد. ژنوم A بیشترین و ژنوم D کمترین تعداد MTA را به خود اختصاص دادند. در بین صفات مورد بررسی در شرایط نرمال، کلروفیل a بیشترین تعداد MTA را روی کروموزوم های ۱A، ۳B، ۳D، ۵B و ۷A نشان داد و برای شرایط تنش شوری ۲۱ MTA شناسایی شد که ژنوم B بیشترین تعداد MTA و ژنوم D کمترین تعداد MTA را به خود اختصاص دادند. برای وزن تر گیاهچه پنج MTA شناسایی شد که روی کروموزوم های ۴A و ۶B قرار داشتند. نتایج پژوهش حاضر، اطلاعات ارزشمندی در ارتباط با مکان های ژنی مرتبط با صفات مورد مطالعه ارائه میدهد که می توان پس از تایید در جمعیت های دو والدی و آزمایش های تکمیلی، در برنامه های بهنژادی گندم در گزینش به کمک نشانگر از این یافته ها استفاده نمود.کلیدواژه ها
Bread wheat cultivars, GWAS, Salt stress, SNP markers, ارقام گندم نان, تنش شوری, نشانگرهای SNP, نقشه یابی ارتباطیاطلاعات بیشتر در مورد COI
COI مخفف عبارت CIVILICA Object Identifier به معنی شناسه سیویلیکا برای اسناد است. COI کدی است که مطابق محل انتشار، به مقالات کنفرانسها و ژورنالهای داخل کشور به هنگام نمایه سازی بر روی پایگاه استنادی سیویلیکا اختصاص می یابد.
کد COI به مفهوم کد ملی اسناد نمایه شده در سیویلیکا است و کدی یکتا و ثابت است و به همین دلیل همواره قابلیت استناد و پیگیری دارد.