همسانه سازی و تحلیل بیوانفورماتیکی ژن کد کننده فاکتور رونویسی MYB۴۴ آفتابگردان تحت تنش شوری

سال انتشار: 1401
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: فارسی
مشاهده: 168

فایل این مقاله در 12 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این مقاله:

شناسه ملی سند علمی:

JR_GEB-11-1_001

تاریخ نمایه سازی: 15 اسفند 1401

چکیده مقاله:

آفتابگردان دانه ­ روغنی (Helianthus annuus L.) به ­طور گسترده در سراسر جهان کشت می­شود. شوری خاک بر بسیاری از صفات مورفولوژیک و فیزیولوژیک آفتابگردان تاثیر منفی می­گذارد. ژن های MYB  بخشی از یک خانواده ژنی بزرگ از فاکتورهای رونویسی هستند که پروتئین های هسته ای را رمزگذاری می­کنند و در مقاومت به شوری دخالت دارند. آفتابگردان روغنی متحمل به تنش شوری (AS۵۳۰۵)، در محیط کنترل شده در قالب طرح کاملا تصادفی با دو تکرار زیستی در شرایط نرمال و تنش شوری کشت شد. تنش شوری  هشت دسی زیمنس بر متر در مرحله هشت برگی از منبع NaCl اعمال گردید. حدود ۲۴ ساعت پس از اعمال تنش شوری نمونه­ برداری از برگ­ها انجام گرفت. ژن MYB۴۴، به ­عنوان یکی از ژن­های دخیل در مقاومت به تنش شوری، در ناقل­های بیانی p۳۵s-N و p۳۵s-G همسانه­ سازی شده و تجزیه بیوانفورماتیکی بر روی آن انجام گرفت. تجزیه و تحلیل توالی MYB۴۴ کلون شده به ترتیب بیش از ۹۵% و ۹۸% شباهت DNA  و پروتئین را بین ژن کلون شده با توالی MYB۴۴ در NCBI نشان داد که نشان دهنده حفظ شدگی توالی بالای این ژن در بین ژنوتیپ های مختلف آفتابگردان است. به طور کلی، نتایج مطالعه حاضر بالقوه راه را برای به ­نژادی مولکولی آفتابگردان برای مقاومت به شوری هموار می­نماید.

نویسندگان

معصومه شریفی

Department of Plant Breeding and Biotechnology, Faculty of Agriculture, Urmia University, Urmia. Iran.

رضا درویش زاده

Department of Plant Production and Genetics, Faculty of Agriculture, Urmia University, Urmia. Iran.

محمد احمدآبادی

Department of Agricultural Biotechnology, Faculty of Agriculture, Azarbaijan Shahid Madani University, Tabriz, Iran

کریم حسن پور

Department of Animal Science, Faculty of Agriculture, Tabriz University, Tabriz, Iran.

مهدی ایمانی

Department of Basic Sciences, Faculty of Veterinary Medicine, Urmia University, Urmia, Iran.

مراجع و منابع این مقاله:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :
  • Ahmadpour S, Sofalian O, Darvishzadeh R. ۲۰۱۷. Genetic diversity of ...
  • Ambawat S, Sharma P, Yadav NR, Yadav RC. ۲۰۱۳. MYB ...
  • Bolger AM, Lohse M, Usadel B. ۲۰۱۴. Trimmomatic: a flexible ...
  • Chandra K, Salman AS, Mohd A, Sweety R, Ali KN. ...
  • Dana H, Mahmoodi Chalbatani G, Mahmoodzadeh H, Karimloo R, Rezaiean ...
  • Dang ZH, Qi Q, Zhang HR, Li HY, Wu SB ...
  • Darabi S, Ramezani S, Ahmadabadi M. ۲۰۱۷. Cloning of human ...
  • Darvishzadeh R, Azizi M, Hatami-Maleki H, Bernousi I, Abdollahi Mandoulakani ...
  • He Y, Li M, Wang Y, Shen S. ۲۰۲۲. The ...
  • Hu L, Li H, Chen L, Lou Y, Amombo E, ...
  • Hwang O. ۲۰۱۳. Role of Oxidative Stress in Parkinson's Disease. ...
  • Khan et al. ۲۰۱۴. Role of proline to induce salinity ...
  • Li J, Zhao S, Yu X, Du W, Li H, ...
  • Liu J, Zhou Y, Luo C, Xiang Y, An L. ...
  • Mirpoor S F, Giosafatto C V L, and Porta R. ...
  • Moradi M, Atarodi K, Mohammadipour M, Mousavi Hosseini K. ۲۰۱۸. ...
  • Paniego N, Muñoz M, Echaide M, Fernandez L, Faccio P, ...
  • Seo J, Sohn H, Noh K, Jung CAJ, Donovan C, ...
  • Shamloo Dasht Pagardi R, Ebrahimi I, Razi H, Alemzadeh A, ...
  • Sharghi L, Mahmoudi F, Ahmadabadi M. ۲۰۱۵. Improving salt tolerance ...
  • Shoushi Dezfuli AA, Kalantar Ahmadi A. ۲۰۱۸. Gene expression patterns ...
  • Vaidyanathan H, Sivakumar P, Chakrabarty R, Thomas G. ۲۰۰۳. Scavenging ...
  • Zhao QY, Wang Y, Kong YM, Luo D, Li X, ...
  • نمایش کامل مراجع