محمد حاجی زاده - استادیار گروه گیاهپزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه کردستان
نعمت سخندان بشیر - دانشیار گروه گیاهپزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه تبریز

به­منظور تعیین مشخصات مولکولی و بررسی ساختارهای ثانویه ویروئید لکه زردی- ۱ مو، ۱۳۷ نمونه از تاکستان­های استان­های اردبیل، آذربایجان­­­ شرقی و آذربایجان­ غربی جمع­آوری گردید. اسید نوکلئیک کل از بافت برگ نمونه­ها استخراج و پس از ساخت دی­ان­ای مکمل با استفاده از آغازگر شش­نوکلئوتیدی تصادفی، طول کامل این ویروئید با روش پی­سی­آر و با استفاده از آغازگرهای اختصاصی ویروئید لکه زردی -۱ مو،  تکثیر شد. محصول پی­سی­آر پس از همسانه­سازی در حامل pGEMT-easy، تعیین­توالی گردید. نتایج نشان داد که واریانت­های شناسایی­شده در این تحقیق، دارای ۳۶۷ یا ۳۶۸ نوکلئوتید هستند و در مجموع هفت واریانت جدید از این ویروئید تشخیص داده شد. درخت تبارزایی نشان داد که واریانت ۶ مشابه اعضای تیپ یک این ویروئید و شش واریانت بعدی در کنار تعدادی جدایه و واریانت دیگر تشکیل یک تیپ جداگانه (به­نام پیشنهادی تیپ ۴) را می­دهند. در ساختار ثانویه واریانت­های به­دست­آمده در این تحقیق، بیشترین تفاوت در منطقه متغیر و قسمت انتهایی چپ قرار داشت. ویروئید لکه زردی-۱ مو برای اولین بار از استان­های آذربایجان­شرقی و اردبیل گزارش می­شود.

آرتی- پی سی آر, ساختار ثانویه, مو, واریانت