تعیین مشخصات مولکولی و تبارزایی ویروئید لکه زردی-۱ مو (Grapevine yellow speckle viroid-۱) از تاکستان های شمال غرب کشور
- سال انتشار: 1392
- محل انتشار: پژوهش های کاربردی در گیاه پزشکی، دوره: 2، شماره: 1
- کد COI اختصاصی: JR_ARPP-2-1_003
- زبان مقاله: فارسی
- تعداد مشاهده: 233
نویسندگان
استادیار گروه گیاهپزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه کردستان
دانشیار گروه گیاهپزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه تبریز
چکیده
بهمنظور تعیین مشخصات مولکولی و بررسی ساختارهای ثانویه ویروئید لکه زردی- ۱ مو، ۱۳۷ نمونه از تاکستانهای استانهای اردبیل، آذربایجان شرقی و آذربایجان غربی جمعآوری گردید. اسید نوکلئیک کل از بافت برگ نمونهها استخراج و پس از ساخت دیانای مکمل با استفاده از آغازگر ششنوکلئوتیدی تصادفی، طول کامل این ویروئید با روش پیسیآر و با استفاده از آغازگرهای اختصاصی ویروئید لکه زردی -۱ مو، تکثیر شد. محصول پیسیآر پس از همسانهسازی در حامل pGEMT-easy، تعیینتوالی گردید. نتایج نشان داد که واریانتهای شناساییشده در این تحقیق، دارای ۳۶۷ یا ۳۶۸ نوکلئوتید هستند و در مجموع هفت واریانت جدید از این ویروئید تشخیص داده شد. درخت تبارزایی نشان داد که واریانت ۶ مشابه اعضای تیپ یک این ویروئید و شش واریانت بعدی در کنار تعدادی جدایه و واریانت دیگر تشکیل یک تیپ جداگانه (بهنام پیشنهادی تیپ ۴) را میدهند. در ساختار ثانویه واریانتهای بهدستآمده در این تحقیق، بیشترین تفاوت در منطقه متغیر و قسمت انتهایی چپ قرار داشت. ویروئید لکه زردی-۱ مو برای اولین بار از استانهای آذربایجانشرقی و اردبیل گزارش میشود.کلیدواژه ها
آرتی- پی سی آر, ساختار ثانویه, مو, واریانتاطلاعات بیشتر در مورد COI
COI مخفف عبارت CIVILICA Object Identifier به معنی شناسه سیویلیکا برای اسناد است. COI کدی است که مطابق محل انتشار، به مقالات کنفرانسها و ژورنالهای داخل کشور به هنگام نمایه سازی بر روی پایگاه استنادی سیویلیکا اختصاص می یابد.
کد COI به مفهوم کد ملی اسناد نمایه شده در سیویلیکا است و کدی یکتا و ثابت است و به همین دلیل همواره قابلیت استناد و پیگیری دارد.