تعیین ترادف ژن پروتئین پوششی دو جدایه ایرانی ویروس موزائیک هندوانه و بررسی جایگاه فیلوژنتیکی آنها
- سال انتشار: 1396
- محل انتشار: پژوهش های کاربردی در گیاه پزشکی، دوره: 6، شماره: 1
- کد COI اختصاصی: JR_ARPP-6-1_003
- زبان مقاله: فارسی
- تعداد مشاهده: 170
نویسندگان
استاد گروه گیاهپزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه شهید باهنر.
دانشجوی سابق کارشناسی ارشد گروه گیاهپزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه شهید باهنر کرمان.
مربی گروه گیاهپزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه جیرفت.
دانشیار بیماری شناسی گیاهی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه شهید باهنر کرمان.
دانشیار بیماری شناسی گیاهی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه شهید باهنر کرمان.
چکیده
چکیده ویروس موزاییک هندوانه (WMV) Watermelon mosaic virusمتعلق به جنس Potyvirus و خانواده Potyviridae از ویروسهای مهم آلوده کننده کدوئیان در دنیا محسوب میشود. دو جدایه این ویروس به نامهای YAZ.WMV.۴۱ و YAZ.WMV.۵۵ از مزارع خیار و طالبی استان یزد جمعآوری گردید. آلودگی نمونهها با آزمون سرولوژیکی الایزای مستقیم و غیرمستقیم و آنتی بادی پلی کلونال این ویروس بررسی شد. این دو جدایه در مقابل آنتیبادی واکنش نشان ندادند. در بررسی علائم این جدایهها برروی گیاهان آزمون کدوی مراغه، لوبیا چیتی و لوبیا چشم بلبلی، علائم متفاوتی با آنچه تا کنون در مورد جدایههای این ویروس گزارش شده، مشاهده گردید. با استفاده از آغازگرهای اختصاصی قطعهای به طول ۸۰۹ جفت باز از ژن پروتئین پوششی تکثیر و تعیین ترادف شد. مقایسهی ترادف های بدست آمده در این تحقیق با ترادف های موجود در بانک جهانی ژن نشان داد که جدایههای مورد مطالعه به همراه یک جدایهی ایرانی (رس شمار EU۶۶۷۶۲۷) با دامنهی میزبانی متفاوت، در زیر گروه IIB قرار میگیرند. سایر جدایههای ایرانی گزارش شده قبلی در گروههای I و AII قرار گرفتند. مقایسهی میزان تشابه اسید نوکلئیک این جدایهها با یکدیگر نشان داد که جدایههای ایرانی مربوط به این مطالعه بیشترین و کمترین میزان شباهت را با جدایههای کشورهای اسپانیا (رس شمار AJ۵۷۹۵۱۸) و ایران (رس شمار GQ۴۲۱۱۶۱) به ترتیب به میزان ۵/۹۹ و ۲/۹۲ درصد دارا می باشند. نتایج حاصل از این تحقیق بیانگر این است که کدوئیاندر مزارع وگلخانههای ایران بوسیله جدایههای متعدد این ویروس آلوده می شوند.کلیدواژه ها
الایزا, کدوئیان, واکنش زنجیره ای پلیمراز, ویروس موزائیک هندوانهاطلاعات بیشتر در مورد COI
COI مخفف عبارت CIVILICA Object Identifier به معنی شناسه سیویلیکا برای اسناد است. COI کدی است که مطابق محل انتشار، به مقالات کنفرانسها و ژورنالهای داخل کشور به هنگام نمایه سازی بر روی پایگاه استنادی سیویلیکا اختصاص می یابد.
کد COI به مفهوم کد ملی اسناد نمایه شده در سیویلیکا است و کدی یکتا و ثابت است و به همین دلیل همواره قابلیت استناد و پیگیری دارد.