ارزیابی تنوع ژنتیکی فندق با استفاده از نشانگر ISSR و رتروترانسپوزون در منطقه املش
- سال انتشار: 1401
- محل انتشار: فصلنامه علوم باغبانی ایران، دوره: 53، شماره: 2
- کد COI اختصاصی: JR_JHS-53-2_015
- زبان مقاله: فارسی
- تعداد مشاهده: 231
نویسندگان
دانشجوی کارشناسی ارشد، گروه بیوتکنولوژی کشاورزی، دانشکده علوم کشاورزی، دانشگاه گیلان، رشت، ایران
استادیار، گروه بیوتکنولوژی کشاورزی، دانشکده علوم کشاورزی، دانشگاه گیلان، رشت، ایران
استاد، گروه بیوتکنولوژی کشاورزی، دانشکده علوم کشاورزی، دانشگاه گیلان، رشت، ایران
چکیده
در این تحقیق تنوع ژنتیکی ۶۳ ژنوتیپ فندق با استفاده از ۱۰ آغازگر ISSR، دو نشانگر رتروترانسپوزون و هفت آغازگر ترکیبی ISSR و رتروترانسپوزون مورد ارزیابی قرار گرفتند که از هفت آغازگر ترکیبی فقط سه آغازگر باندهای واضح و مشخصی را نشان دادند و سایر آغازگرها باندی تشکیل نشد. پانزده آغازگر مورد استفاده در این مطالعه، توانستند در مجموع ۱۱۶ باند چند شکل ایجاد کنند. آغازگر UBC۸۲۲ با تعداد ۱۴ باند بیشترین و آغازگر UBC۸۱۴ با تعداد ۳ باند کمترین تعداد نوار چندشکل را ایجاد کردند. میزان اطلاعات چند شکلی آغازگرها بین ۱۸/۰ تا ۴۴/۰ و شاخص نشانگر از ۵۰/۰ تا ۳۱/۱۱ متغیر بود. تجزیه به مختصات اصلی نشان داد سه مولفه اول توانستند در مجموع ۱۲/۳۷ درصد از واریانس کل را توجیه کنند. تجزیه خوشه ای به روش COMPLETE، ۶۳ ژنوتیپ مورد مطالعه را در هفت گروه قرار داد، که به ترتیب در هر گونه ۸، ۱۳، ۷، ۳، ۳، ۱۳، ۱۶ ژنوتیپ قرار داده شدند. صحت گروهبندی حاصل از تجزیه خوشهای توسط تابع تشخیص کانونی به روش خطی فیشر با ۸۱ درصد برآورد شد. در مجموع، آغازگرهای UBC۸۲۲، UBC۸۱۳ و Tos۲ و ترکیب آغازگر TOS۱+TOS۲ می توانند به عنوان آغازگرهای مفید و مطلوب برای تفکیک ژنوتیپهای فندق معرفی شوند.کلیدواژه ها
تجزیه تابع تشخیص, تجزیه خوشه ای, ضریب اطلاعات چندشکلی, Corylus avellana L.اطلاعات بیشتر در مورد COI
COI مخفف عبارت CIVILICA Object Identifier به معنی شناسه سیویلیکا برای اسناد است. COI کدی است که مطابق محل انتشار، به مقالات کنفرانسها و ژورنالهای داخل کشور به هنگام نمایه سازی بر روی پایگاه استنادی سیویلیکا اختصاص می یابد.
کد COI به مفهوم کد ملی اسناد نمایه شده در سیویلیکا است و کدی یکتا و ثابت است و به همین دلیل همواره قابلیت استناد و پیگیری دارد.