شناسایی ویروس های آران ای دار همراه با زردی کدوئیان در جنوب شرق ایران و تنوع ژنتیکی ویروس شایع آن

  • سال انتشار: 1398
  • محل انتشار: پژوهش های کاربردی در گیاه پزشکی، دوره: 8، شماره: 4
  • کد COI اختصاصی: JR_ARPP-8-4_002
  • زبان مقاله: فارسی
  • تعداد مشاهده: 275
دانلود فایل این مقاله

نویسندگان

زهرا صادقی

دانشجوی دکتری ویروس شناسی و بیماری های ویروسی گیاهی، گروه گیاهپزشکی، دانشگاه علوم کشاورزی ومنابع طبیعی گرگان، گرگان، ایران.

سعید نصراله نژاد

دانشیار گروه گیاهپزشکی، دانشگاه علوم کشاورزی ومنابع طبیعی گرگان، گرگان، ایران.

میلاد لکزیان

استادیار گروه گیاهپزشکی، دانشگاه علوم کشاورزی ومنابع طبیعی گرگان، گرگان، ایران.

سیداسماعیل رضوی

استادیار گروه زیست شناسی، دانشگاه سیستان و بلوچستان، زاهدان، ایران.

مجید جعفری

استادیار گروه گیاهپزشکی، مجتمع آموزش عالی سراوان، ایران.

چکیده

چکیده بیماری­های زردی محصولات در گلخانه و مزارع کدوئیان که توسط ویروس­های قابل انتقال با مگس سفیدBemisia) (tabaci ایجاد می­شود به طور فزاینده­ای در جهان و ایران در حال افزایش می­باشند. به منظور بررسی آلودگی­های ویروسی در استان سیستان و بلوچستان، تعداد ۱۹۵ نمونه­ی برگ دارای علایم ویروسی جمع آوری و آلودگی آن­ها به برخی از ویروس­های شایع کدوئیان از طریق RT-PCR با آغازگرهای اختصاصی مورد بررسی و برخی از آنها تعیین توالی شدند. نتایج بدست آمده نشانگر آلودگی ۵۹ % نمونه­ها به ویروس­های غالب کدوئیان در کلیه­ی مناطق مورد بررسی بود. برخی از نمونه­ها به ویروس اختلال کوتولگی زرد کدوئیان (Cucurbit yellow stunting disorder virus)، ویروس زردی شته زاد کدوئیان (Cucurbit AphidBorneYellows virus)، ویروس زردی رگبرگ خیار (Cucumber vein yellowing virus)، ویروس زردی کلروتیک کدوئیان (Cucurbit chlorotic yellows virus) و ویروس کوتولگی سبززرد هندوانه ((Watermelon chlorotic stunt virus آلوده بودند. بیشترین میزان آلودگی نمونه­های جمع آوری شده به ترتیب ۴۳، ۲۸ و ۸ درصد مربوط به ویروس­های WCSV، CVYV و CYSDV بود. نتایج آنالیزهای تبارزایی روی جدایه­های CYSDV نشان داد که جدایه­ها در دو زیرگروه شرقی و غربی و دو جدایه SB و SB۲ همراه با ۱۲ جدایه­ی ایرانی و چهار جدایه­ی عربستان در زیرگروه شرقی قرار گرفتند. همچنین مطالعات ژنتیکی روی بخشی از ژن پروتئین پوششی نشان داد که در جدایه­های ایرانی و زیرگروه شرقی، جهش CGA به CCA اتفاق افتاده که منجر به جایگزینی آرژنین به جای گلوتامین در کدون ۷۳ پروتئین پوششی شده است. بنابراین اختلاف نوکلئوتیدی جدایه­های ایرانی در مقایسه با جدایه­های مناطق مختلف نشان­دهنده­ی تنوع ژنتیکی بالا و قدمت طولانی این ویروس بومی در ایران است

کلیدواژه ها

واژه­های کلیدی: آلودگی­های ویروسی, استان سیستان و بلوچستان, تنوع ژنتیکی, ویروس اختلال کوتولگی زرد کدوئیان (CYSDV)

اطلاعات بیشتر در مورد COI

COI مخفف عبارت CIVILICA Object Identifier به معنی شناسه سیویلیکا برای اسناد است. COI کدی است که مطابق محل انتشار، به مقالات کنفرانسها و ژورنالهای داخل کشور به هنگام نمایه سازی بر روی پایگاه استنادی سیویلیکا اختصاص می یابد.

کد COI به مفهوم کد ملی اسناد نمایه شده در سیویلیکا است و کدی یکتا و ثابت است و به همین دلیل همواره قابلیت استناد و پیگیری دارد.