مطالعه ساختار ژنتیکی جمعیت گوسفند شین بش با استفاده از نشانگرهای مولکولی
- سال انتشار: 1401
- محل انتشار: مجله تحقیقات تولیدات دامی، دوره: 11، شماره: 3
- کد COI اختصاصی: JR_ARGU-11-3_003
- زبان مقاله: فارسی
- تعداد مشاهده: 213
نویسندگان
استادیار، موسسه تحقیقات علوم دامی کشور، سازمان تحقیقات آموزش و ترویج کشاورزی، کرج، ایران
استادیار، گروه علوم دامی، واحد مهاباد، دانشگاه آزاد اسلامی
چکیده
در این تحقیق جهت مطالعه ساختار ژنتیکی جمعیت گوسفند شین بش، تعداد ۷۵ نمونه خون از محل پراکنش این حیوانات جمعآوری شد. استخراج DNA با روش بهینه یافته Salting-Out انجام گرفت. تعداد ۱۰ جایگاه ریزماهواره و یک ناحیه کنترلی D-Loop مربوط به DNA میتوکندریایی (mtDNA) مورد مطالعه قرار گرفت. برای تکثیر جایگاههای ریزماهواره از یک PCR چندگانه استفاده شد. آغازگرهای انتخابی نشاندار شده و با استفاده از دستگاه Genetic Analyser تعیین ژنوتیپ افراد انجام گرفت. در مجموع، ۸۴ آلل در جمعیت مورد مطالعه شناسایی شد، لذا متوسط تعداد آلل به ازای هر نشانگر برابر با ۴/۸ بود. میانگین هتروزیگوسیتی مورد انتظار و هتروزیگوسیتی مشاهده شده در این جمعیت به ترتیب برابر با ۰۴۲/۰±۷۲۴/۰ و ۰۵۸/۰±۸۰/۰ بود. مقدار FIS در این جمعیت برابر با ۱۰۸/۰- بود که نشاندهنده غیرهمخون بودن و وجود تنوع قابل توجه در این جمعیت است. نتایج حاصل از ناحیه کنترلی mtDNA نشان داد که میزان تنوع هاپلوتیپی و درصد جایگاههای چندشکل در این جمعیت به ترتیب ۰۳۹/۰±۹۳۸/۰ و ۵۹/۴ است. از مجموع ۲۴ نمونه تعیین توالی شده در ناحیه کنترلی mtDNA، تعداد ۱۷ هاپلوتیپ در جمعیت مورد مطالعه مشخص شد. میزان تنوع نوکلئوتیدی در جمعیت شین بش، ۰۰۱۳/۰±۰۱۳۱/۰ به ازای هر جایگاه بهدست آمد. نتایج این تحقیق نشان داد که ۵۰ درصد از افراد جمعیت شین بش دارای هاپلوگروه A، ۲/۲۹ درصد افراد دارای هاپلوگروه B و ۸/۲۰ درصد افراد دارای هاپلوگروه C هستند.کلیدواژه ها
خصوصیات ژنتیکی, گوسفند شین بش, نشانگر ریزماهواره, DNA میتوکندریاییاطلاعات بیشتر در مورد COI
COI مخفف عبارت CIVILICA Object Identifier به معنی شناسه سیویلیکا برای اسناد است. COI کدی است که مطابق محل انتشار، به مقالات کنفرانسها و ژورنالهای داخل کشور به هنگام نمایه سازی بر روی پایگاه استنادی سیویلیکا اختصاص می یابد.
کد COI به مفهوم کد ملی اسناد نمایه شده در سیویلیکا است و کدی یکتا و ثابت است و به همین دلیل همواره قابلیت استناد و پیگیری دارد.