پویش کل ژنومی صفات مرتبط با وزن تخم مرغ در نژاد رد آیلند رد با استفاده از روش های بیزی
عنوان مقاله: پویش کل ژنومی صفات مرتبط با وزن تخم مرغ در نژاد رد آیلند رد با استفاده از روش های بیزی
شناسه ملی مقاله: JR_ARGU-11-3_004
منتشر شده در در سال 1401
شناسه ملی مقاله: JR_ARGU-11-3_004
منتشر شده در در سال 1401
مشخصات نویسندگان مقاله:
امیر حسین خلت آبادی فراهانی - دانشیار، گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی و منابع طبیعی، دانشگاه اراک
حسین محمدی - استادیار، گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی و منابع طبیعی، دانشگاه اراک
محمد حسین مرادی - دانشیار، گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی و منابع طبیعی، دانشگاه اراک
حسینعلی قاسمی - دانشیار، گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی و منابع طبیعی، دانشگاه اراک
ایمان حاج خدادادی - دانشیار، گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی و منابع طبیعی، دانشگاه اراک
خلاصه مقاله:
امیر حسین خلت آبادی فراهانی - دانشیار، گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی و منابع طبیعی، دانشگاه اراک
حسین محمدی - استادیار، گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی و منابع طبیعی، دانشگاه اراک
محمد حسین مرادی - دانشیار، گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی و منابع طبیعی، دانشگاه اراک
حسینعلی قاسمی - دانشیار، گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی و منابع طبیعی، دانشگاه اراک
ایمان حاج خدادادی - دانشیار، گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی و منابع طبیعی، دانشگاه اراک
تحقیق حاضر با هدف شناسایی مناطق ژنومی و ژنهای کاندیدای مرتبط با صفات وزن تخم مرغ، بر اساس پویش ژنومی با استفاده از تراشه پربرونداد Affymetrix ۶۰۰K chip در ۱۰۷۸ پرنده نسل یازدهم مرغ نژاد رد آیلند رد انجام شد. برای هر پرنده، هفت صفت شامل وزن تخم مرغ در اولین تخمگذاری، و وزن تخم مرغ در سنین ۲۸، ۳۶، ۵۶، ۶۶، ۷۲ و ۸۰ هفتگی جمعآوری شده بود. ارتباط بین هر یک از نشانگرهای چندشکل تک نوکلئوتیدی (SNP) و صفات مختلف با استفاده از روشهای بیز A و B در نرمافزار GenSel نسخه ۹۰/۴ بررسی شد. در مجموع، نتایج این تحقیق نشان داد روش بیز A از نظر میزان واریانس ژنتیکی افزایشی توجیه شده در مقایسه با روش بیز B دارای عملکرد بهتری بود. تعداد نه نشانگر حاصل از روش بیزA با بیشترین میزان واریانس ژنتیکی روی کروموزومهای شماره ۱، ۳، ۵ و ۲۰ قرار داشتند. SNPهای شناسایی شده در نزدیکی ۳۵ ژن قرار گرفته بودند که از این میان، ژنهای کاندیدای BPIFB۲، OCX۳۶، CPT۱A، TCF۱۵، CECR۲، SIAH۳، FADS۱، FADS۲ و SGK۱ عملکردهای مهمی را در فرآیند تولید تخم مرغ از راه تشکیل پروتئین آلبومین، سوخت و ساز اسیدهای چرب و تشکیل پوسته تخم مرغ داشتند. نتایج تحقیق حاضر نشان میدهد هنگامی که معماری صفات بررسی شده از مدل تعداد زیاد جایگاه ژنی پیروی کند، معمولا روش بیز A بر روش بیز B برتری دارد. علاوه بر این، با توجه به شناسایی مناطق ژنومی جدید و نقش کلیدی ژنهای ذکر شده در ایجاد وزن تخم مرغ، میتوان کارآیی روش بیز A برای پویش ژنومی در صفات وزن تخم مرغ را تایید کرد.
کلمات کلیدی: پویش ژنومی, روش بیزی, ژن کاندیدا, وزن تخم مرغ
صفحه اختصاصی مقاله و دریافت فایل کامل: https://civilica.com/doc/1599861/