پویش کل ژنومی صفات مرتبط با وزن تخم مرغ در نژاد رد آیلند رد با استفاده از روش های بیزی
- سال انتشار: 1401
- محل انتشار: مجله تحقیقات تولیدات دامی، دوره: 11، شماره: 3
- کد COI اختصاصی: JR_ARGU-11-3_004
- زبان مقاله: فارسی
- تعداد مشاهده: 298
نویسندگان
دانشیار، گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی و منابع طبیعی، دانشگاه اراک
استادیار، گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی و منابع طبیعی، دانشگاه اراک
دانشیار، گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی و منابع طبیعی، دانشگاه اراک
دانشیار، گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی و منابع طبیعی، دانشگاه اراک
دانشیار، گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی و منابع طبیعی، دانشگاه اراک
چکیده
تحقیق حاضر با هدف شناسایی مناطق ژنومی و ژنهای کاندیدای مرتبط با صفات وزن تخم مرغ، بر اساس پویش ژنومی با استفاده از تراشه پربرونداد Affymetrix ۶۰۰K chip در ۱۰۷۸ پرنده نسل یازدهم مرغ نژاد رد آیلند رد انجام شد. برای هر پرنده، هفت صفت شامل وزن تخم مرغ در اولین تخمگذاری، و وزن تخم مرغ در سنین ۲۸، ۳۶، ۵۶، ۶۶، ۷۲ و ۸۰ هفتگی جمعآوری شده بود. ارتباط بین هر یک از نشانگرهای چندشکل تک نوکلئوتیدی (SNP) و صفات مختلف با استفاده از روشهای بیز A و B در نرمافزار GenSel نسخه ۹۰/۴ بررسی شد. در مجموع، نتایج این تحقیق نشان داد روش بیز A از نظر میزان واریانس ژنتیکی افزایشی توجیه شده در مقایسه با روش بیز B دارای عملکرد بهتری بود. تعداد نه نشانگر حاصل از روش بیزA با بیشترین میزان واریانس ژنتیکی روی کروموزومهای شماره ۱، ۳، ۵ و ۲۰ قرار داشتند. SNPهای شناسایی شده در نزدیکی ۳۵ ژن قرار گرفته بودند که از این میان، ژنهای کاندیدای BPIFB۲، OCX۳۶، CPT۱A، TCF۱۵، CECR۲، SIAH۳، FADS۱، FADS۲ و SGK۱ عملکردهای مهمی را در فرآیند تولید تخم مرغ از راه تشکیل پروتئین آلبومین، سوخت و ساز اسیدهای چرب و تشکیل پوسته تخم مرغ داشتند. نتایج تحقیق حاضر نشان میدهد هنگامی که معماری صفات بررسی شده از مدل تعداد زیاد جایگاه ژنی پیروی کند، معمولا روش بیز A بر روش بیز B برتری دارد. علاوه بر این، با توجه به شناسایی مناطق ژنومی جدید و نقش کلیدی ژنهای ذکر شده در ایجاد وزن تخم مرغ، میتوان کارآیی روش بیز A برای پویش ژنومی در صفات وزن تخم مرغ را تایید کرد.کلیدواژه ها
پویش ژنومی, روش بیزی, ژن کاندیدا, وزن تخم مرغاطلاعات بیشتر در مورد COI
COI مخفف عبارت CIVILICA Object Identifier به معنی شناسه سیویلیکا برای اسناد است. COI کدی است که مطابق محل انتشار، به مقالات کنفرانسها و ژورنالهای داخل کشور به هنگام نمایه سازی بر روی پایگاه استنادی سیویلیکا اختصاص می یابد.
کد COI به مفهوم کد ملی اسناد نمایه شده در سیویلیکا است و کدی یکتا و ثابت است و به همین دلیل همواره قابلیت استناد و پیگیری دارد.