تعیین تنوع قارچی در یک منطقه نیمه خشک بیابانی با استفاده از توالی یابی نسل دوم

  • سال انتشار: 1401
  • محل انتشار: فصلنامه زیست شناسی میکروارگانیسمها، دوره: 11، شماره: 44
  • کد COI اختصاصی: JR_BJM-11-44_013
  • زبان مقاله: فارسی
  • تعداد مشاهده: 344
دانلود فایل این مقاله

نویسندگان

مریم تیموری

گروه میکروبیولوژی، دانشکده علوم زیستی، دانشگاه الزهرا، تهران، ایران- موسسه تحقیقات جنگل ها و مراتع، سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی، تهران، ایران

پریسا محمدی

گروه میکروبیولوژی، دانشکده علوم زیستی، دانشگاه الزهرا س، تهران، ایران، مرکز تحقیقات میکروبیولوژی کاربردی و بیوتکنولوژی میکروبی، دانشگاه الزهرا، تهران، ایران

عادل جلیلی

استاد موسسه تحقیقات جنگل ها و مراتع، سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی، تهران، ایران

چکیده

چکیده مقدمه: اهمیت قارچ ها در اکوسیستم های خشکی بسیار درخور توجه است؛ با وجود این، دانش ما درباره انتشار و تنوع قارچ ها در زیستگاه های طبیعی به ویژه اکوسیستم های نیمه خشک کم است. به منظور داشتن اطلاعات مناسب از ساختار جوامع قارچی و تاثیرعوامل محیطی بر ترکیب جوامع قارچی چنین محیط هایی، تنوع قارچی در کنار ویژگی های شیمیایی خاک بررسی شد. مواد و روشها: نمونه برداری از خاک در بهار و تابستان از دو ناحیه سرد و گرم اکوسیستم نیمه خشک واقع در استان کرمان انجام شد. ویژگی های شیمیایی خاک با استفاده از روش های استاندارد خاک تعیین شدند. قارچ های ساکن در خاک با استفاده از توالی یابی نسل دوم ناحیه ITS (ITS۱f-ITS۲) تعیین شدند. نتایج: با تجزیه و تحلیل یافته های حاصل از پلت فرم Illumina Miseq، ۱۵۴۲ واحد عملکردی تاکسونومی در نمونه های خاک مطالعه شده شناسایی شدند. تفاوت مشاهده شده در ترکیب جمعیت قارچی دو ناحیه سرد و گرم می تواند ناشی از اختلاف چشمگیر شرایط محیطی این دو ناحیه ازجمله تفاوت در میزان رطوبت و کربن آلی خاک باشد. آسکومیکوتا، شاخه غالب قارچی شناسایی شده بود و در مرتبه بعدی بازیدیومیکوتا فراوانی بیشتری داشت. بحث و نتیجه گیری: قارچ های متنوعی در این اکوسیستم شناسایی شدند. برای آگاهی از نقش گونه های غالب قارچی در اکوسیستم های نیمه خشک به مطالعات بیشتری نیاز است.

کلیدواژه ها

تعیین توالی جوامع قارچی, ترکیب جوامع قارچی, غناء, یکدستی

اطلاعات بیشتر در مورد COI

COI مخفف عبارت CIVILICA Object Identifier به معنی شناسه سیویلیکا برای اسناد است. COI کدی است که مطابق محل انتشار، به مقالات کنفرانسها و ژورنالهای داخل کشور به هنگام نمایه سازی بر روی پایگاه استنادی سیویلیکا اختصاص می یابد.

کد COI به مفهوم کد ملی اسناد نمایه شده در سیویلیکا است و کدی یکتا و ثابت است و به همین دلیل همواره قابلیت استناد و پیگیری دارد.