کشف مهار کننده های جدید آنزیم پروتئاز اصلی موثر در درمان کوید-۱۹ به روش غربال گری مجازی مبتنی بر ساختار و داکینگ مولکولی

مقدمه و هدف: در این مطالعه به منظور کشف داروهای موثر برای مهار آنزیم Nsp-۱۶ و جلوگیری از تکثیر ویروس کووید۱۹ ، مجموعه ای از تکنیک های غربالگری مجازی، داکینگ مولکولی و شبیه سازی دینامیک مولکولی انجام و بهترین وپایدارترین حالت اتصال ترکیبات و انرژی آنها تخمین زده شد.روش کار : پروتئین مورد نظر آنزیم پروتئیاز Mpro می باشد که اطلاعات ساختاری آن BQY۷.pdb از پایگاه RCSB تهیه شده است.نتایج بر اساس نتایج حاصل از داکینگ مولکولی،۹ لیگاند به عنوان مهارکننده های بالقوه Nsp-۱۶ پیشنهاد شد که نتایج مدل سازی داکینگ مولکولی نشان داد که مهار کننده (N-(۲-Cyclohexylpropyl)-۵-fluoro-۲,۴-dioxo-۳,۴-dihydro-۱(۲H)-pyrimidinecarboxamide)، دارای پروفایلهای بهتری با توجه به قدرت اتصال -۸ ,۱) کیلوکالری بر مول) و ثابت مهار کنندگی ۱,۱۶) میکرومولار) بوده و می توانند پس از کارآزمایی بالینی در درمان کووید- ۱۹ استفاده شود. در ادامه با کمک شبیه سازی دینامیک مولکولی نیز این لیگاند هم رده یا حتی بهتر از دیگر داروهای مورد مطالعه در مهار nsp-۱۶عمل نمود.نتیجه گیری: درنتیجه می توان پس از انجام کارآزمایی بالینی در درمان این بیماری از این ترکیب، استفاده نمود. امیدواریم بهاشتراک گذاری نتایج ما با محققین دیگر درزمینه کووید- ۱۹ ، منجر به کشف هرچه سریعتر داروی قطعی برای درمان این بیماری باشد.

کلیدواژه ها:

پروتئاز ، داکینگ مولکولی ، کووید-۱۹