ردیابی و شناسایی Candidatus phytoplasma trifolii از درختان سیب در ایران
- سال انتشار: 1400
- محل انتشار: پژوهش های کاربردی در گیاه پزشکی، دوره: 10، شماره: 3
- کد COI اختصاصی: JR_ARPP-10-3_004
- زبان مقاله: فارسی
- تعداد مشاهده: 151
نویسندگان
گروه گیاهپزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه زابل
گروه گیاهپزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه زابل
۲بخش تحقیقات گیاه پزشکی، مرکز تحقیقات و آموزش کشاورزی و منابع طبیعی استان خراسان رضوی، سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی، مشهد، ایران.
گروه گیاهپزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه زابل.
گروه گیاهپزشکی، دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی گرگان.
کارشناس بخش مدیریت آب و خاک، سازمان جهاد کشاورزی استان خراسان رضوی- مشهد
چکیده
چکیده در بازدیدهای بهار و تابستان سال ۱۳۹۷ از باغات درختان سیب در استان خراسان رضوی، علائم مشکوک به بیماری فیتوپلاسمایی مانند زردی، ریزبرگی، و همچنین برگ هایی که گوشوارک در آن به طور غیرعادی کشیده شده بود در سطح باغات مشاهده شد و ۳۳ نمونه از برگ درختان جمع آوری گردید. با استفاده از آغازگرهای عمومی P۱ / P۷ و آغازگرهای آشیان های R۱۶F۲n / R۱۶R۲، fU۵ / rU۳ و R۱۶MF۲ / R۱۶MR۲ در واکنش زنجیرهای پلیمراز (PCR) از کلیه نمونههای دارای علائم، قطعات ۱۸۰۰ جفت باز در PCR عمومی و در PCRهای آشیان های به ترتیب قطعات ۱۲۵۰، ۸۷۶ و ۱۴۰۰ جفت باز تکثیر شدند. در نتایج حاصله مشخص گردید ۱۸ نمونه آلوده به فیتوپلاسما مثبت بودند. محصول PCR دومرحلهای با جفت آغازگرهای R۱۶F۲n / R۱۶R۲، همسانهسازی و تعیین ترادف شده و در بانک جهانی ژن ثبت گردید. مقایسه توالی های به دست آمده با توالی های موجود در NCBI توسط نرم افزار BLAST و همچنین بررسی چند شکلی طولی قطعات برشی (RFLP) حقیقی با محصول PCR دومرحله ای با استفاده از آنزیم های AluI، RsaIو Tru۱I (MseI)، نشان داد که فیتوپلاسمای همراه درختان سیب بیشترین شباهت را با Candidatus Phytoplasma trifolii مربوط به گروه افژولش شبدر (Clover proliferation group, ۱۶SrVI) دارند. آنالیز توالی ها با استفاده از نرم افزار iPhyClassifier، تعیین میزان تشابه نوکلئوتیدی و آنالیز تبارزایی با استفاده از ترادف کامل ژن RNA ریبوزومی ۱۶S نیز تعلق فیتوپلاسمای همراه درختان سیب در استان خراسان رضوی را در گروه ۱۶SrVI-A تایید کرد. این اولین گزارش از سیب های آلوده به Ca. Phytoplasma trifolii در ایران و سایر نقاط جهان است.کلیدواژه ها
کلمات کلیدی: آنالیز فیلوژنتیکی, آنزیم برشی, چند شکلی طولی قطعات برشی, زردی, گروه ۱۶SrVIاطلاعات بیشتر در مورد COI
COI مخفف عبارت CIVILICA Object Identifier به معنی شناسه سیویلیکا برای اسناد است. COI کدی است که مطابق محل انتشار، به مقالات کنفرانسها و ژورنالهای داخل کشور به هنگام نمایه سازی بر روی پایگاه استنادی سیویلیکا اختصاص می یابد.
کد COI به مفهوم کد ملی اسناد نمایه شده در سیویلیکا است و کدی یکتا و ثابت است و به همین دلیل همواره قابلیت استناد و پیگیری دارد.