روش ایمونو انفورماتیک برای طراحی واکسن پپتیدی مبتنی بر اپی توپ سلول B و T در برابر هپاتیت A
- سال انتشار: 1401
- محل انتشار: اولین کنگره بین المللی علوم، مهندسی و فن آوری های نو
- کد COI اختصاصی: SECONGRESS01_198
- زبان مقاله: فارسی
- تعداد مشاهده: 627
نویسندگان
گروه میکروبیولوژی، انیستیتو علوم آکادمی زیست پزشکی ابن سینا (ABI)
گروه علوم زیستی، دانشگاه آزاد اسلامی واحد ساری، ساری، ایران
گروه علوم زیستی، مرکز تحقیقات زیست شناسی سلولی و مولکولی، دانشگاه آزاد اسلامی، واحد تهران شمال، تهران، ایران
گروه علوم آزمایشگاهی، دانشکده پیراپزشکی، دانشگاه علوم پزشکی تبریز، تبریز، ایران
گروه میکروبیولوژی، دانشکده علوم زیستی، دانشگاه الزهرا، تهران، ایران
گروه میکروب شناسی پزشکی، دانشکده پزشکی، دانشگاه علوم پزشکی تبریز، تبریز، ایران
چکیده
زمینه و هدف: ویروس هپاتیت HAV)A) یکی از مهم ترین عفونت های ویروسی در جهان است که عامل بیماری هپاتیت A است. HAV توزیعجهانی دارد و سالانه باعث حدود ۱.۵ میلیون مورد هپاتیت بالینی می شود. راه های مختلفی برای پیشگیری از هپاتیت A وجود دارد امابهترین راه واکسیناسیون است. هدف از این مطالعه طراحی واکسن مبتنی بر اپی توپ علیه HAV بر اساس آنالیز In silico برای تعیینحفاظت شده ترین اپی توپ های سلول B و T پروتئین VP۱ بود که قادر به تحریک پاسخ ایمنی قابل توجهی باشد.روش بررسی: توالی پروتئین VP۱ از پایگاه های داده پروتئین (NCBI & Uniprot) جمع آوری شد و با ابزار In silico (IEDB - ABCpred) برای شناسایی حفاظت شده ترین اپی توپ های ایمنی زا برای تحریک پاسخ ایمنی سلول های T و B تجزیه و تحلیل شد. ایناپی توپ های مناسب از نظر سمیت و حساسیت زایی و ایمنی زایی به ترتیب با استفاده از سرورهای Toxinpred ، AllerTop وVaxiJen مورد ارزیابی قرار گرفتند. در نهایت، پروتئین کایمریک به عنوان یک واکسن جدید مبتنی بر اپی توپ به ترتیب توسطسرورهای Prabi Garland و Swiss-model از نظر ساختارهای دو بعدی و سه بعدی طراحی و مورد سنجش قرار گرفت.یافته ها: بر اساس مطالعه ایمونوانفورماتیک، بیشترین اپی توپ (TFTFNSNNKE) و (VGITTMKDLKGKANR) برای تحریکTCD۸ و TCD۴ توسط سرور IEDB پیش بینی شد، همچنین اپی توپ مناسب (SNNKEYT) توسط سرور ABCpred برایتحریک سلول B پیش بینی شد. این پپتیدها به بیشترین تعداد آلل متصل شدند. همچنین اپی توپ های سمی و آلرژی زا نبودند کهتوسط سرورهای Toxinpred و AllerTop بررسی شدند در حالی که ایمنوژن بودند که با سرور VaxiJen مورد ارزیابی قرار گرفت.پروتئین کایمریک طراحی شده از نظر خواص فیزیکوشیمیایی و پایداری مناسب بود.نتیجه گیری: مطالعه ایمونو انفورماتیک نشان داد که اپی توپ های پیش بینی شده دارای کارایی و پایداری بالایی هستند که می توانند به عنوانیک واکسن پپتیدی، درمانی برای پیشگیری از عفونت HAV مورد استفاده قرار گیرند.کلیدواژه ها
ایمنوانفورماتیک، واکسن های بر پایه اپی توپ، هپاتیت Aمقالات مرتبط جدید
- تحلیل چالشها و راهکارهای تقویت ارتباط دانشگاه و صنعت: با تمرکز بر حلقههای مفقوده
- بازخوانی نقش دانشگاه و صنعت در توسعه ملی: از موانع تا راهکارها
- نشانگر تشخیصی جدید در ژن C-myc به عنوان کیت غیر تهاجمی تشخیص سرطان دهان
- برنامه ریزی منابع تجدید پذیر با درنظر گرفتن برنامه ریزی توسعه انتقال و تولید منابع توان راکتیو
- برنامه ریزی همزمان توسعه انتقال و منابع تولید توان راکتیو با استفاده از یک الگوریتم تکاملی بهبود یافته
اطلاعات بیشتر در مورد COI
COI مخفف عبارت CIVILICA Object Identifier به معنی شناسه سیویلیکا برای اسناد است. COI کدی است که مطابق محل انتشار، به مقالات کنفرانسها و ژورنالهای داخل کشور به هنگام نمایه سازی بر روی پایگاه استنادی سیویلیکا اختصاص می یابد.
کد COI به مفهوم کد ملی اسناد نمایه شده در سیویلیکا است و کدی یکتا و ثابت است و به همین دلیل همواره قابلیت استناد و پیگیری دارد.