توصیف ریخت شناختی و مولکولی قارچ بیمارگر حشراتCordyceps farinosa و تجزیه و تحلیل تبارشناسی جنس بر اساس ترادف نواحی ITS-rDNA و –tubulinß
محل انتشار: نامه انجمن حشره شناسی ایران، دوره: 40، شماره: 4
سال انتشار: 1399
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: فارسی
مشاهده: 261
فایل این مقاله در 13 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد
- صدور گواهی نمایه سازی
- من نویسنده این مقاله هستم
استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:
شناسه ملی سند علمی:
JR_JESI-40-4_006
تاریخ نمایه سازی: 18 دی 1401
چکیده مقاله:
طی نمونه برداری از خاک، جدایهای از قارچ های بیمارگر حشرات با استفاده از تله گذاری با لارو سن آخر Galleria mellonella جداسازی و با استفاده از ویژگی های ریخت شناختی و تجزیه و تحلیل تبارشناسی مبتنی بر ترادف های ناحیه ITS-rDNA و ß-tubulin طبق روش های بیشینه پارسیمونی ((Maximum Parsimony شناسایی شد. در کنار بررسی های ریخت شناختی و ریخت سنجی، نتایج تجزیه و تحلیل تبارشناسی مبتنی بر هر دو ناحیه ژنومی درستی شناسایی گونه، به نام Cordyceps farinosa را تایید کرد. در جدایه مورد بررسی، کنیدیوم ها با میانگین طولی ۸۳/۳ و عرض ۹۸/۱ میکرومتر و بیضوی و کنیدی زاها با میانگین طولی ۹۸/۴ و عرض ۲۱/۲ با گلوبوز عریض در بخش قاعدهای می باشند. طول قطعه تکثیر شده طی PCR برای ناحیه ITS، ۶۱۵ و برای ناحیه ژنی بتاتوبولین ۳۵۵جفت باز بود. در تمامی درختان تبارشناسی مبتنی بر هر دو ناحیه ژنی، C. farinosa KJ۳ با جدایه C. farinosa CBS ۵۴۱.۸۱ در یک گروه تکنیایی قرار گرفتند. در درخت تبارشناسی مبتنی بر ترادف ITS-rDNA، گروه متشکل از C. albocitrina وC. coccidioperitheciata و در درخت مبتنی بر ترادف ژنی بتاتوبولین، C. confrogasa به عنوان گروههای خواهری C. farinosa ظاهر شدند. با هدف بررسی کارایی نواحی ژنومی مورد استفاده در مطالعات تبارشناختی جنس به صورت تنها و در ترکیب با هم، درختان تبارشناسی با گونه های مشابه ترسیم و از نظر شاخص ثبات، شاخص بازداری و توپولوژی با هم مقایسه شدند. توپولوژی درخت تبارشناسی حاصل از تلفیق هر دو مکان ژنی پلیتومی کمتر و وضوح بیشتری در بیان روابط گونه ها در مقایسه با درخت مبتنی بر ترادف ITS-rDNA داشت. در مجموع نتایج نشان داد که ترادف ناحیه ژنی بتاتوبولین در مقایسه با ناحیه ITS-rDNA از کارایی بیشتری در مطالعات تبارشناسی در جنس Cordyceps برخوردار می باشد.
کلیدواژه ها:
نویسندگان
ژیلا علیزاده
گروه گیاه پزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه شهید مدنی آذربایجان
ناصر عیوضیان کاری
گروه گیاه پزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه شهید مدنی آذربایجان
داود محمدی
گروه گیاه پزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه شهید مدنی آذربایجان
علی مهرور
گروه گیاه پزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه شهید مدنی آذربایجان
مراجع و منابع این مقاله:
لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :