Research Article: Bioinformatics and mRNA expression of catalase gene and determination of catalase enzyme activity in zebrafish (Danio rerio) exposed to the herbicide paraquat
- سال انتشار: 1401
- محل انتشار: مجله علوم شیلات ایران، دوره: 21، شماره: 5
- کد COI اختصاصی: JR_JIFRO-21-5_012
- زبان مقاله: انگلیسی
- تعداد مشاهده: 301
نویسندگان
چکیده
Effects of two different doses, treatment I (۰.۳۰ ppm) and treatment II (۰.۱۵ ppm) of paraquat, were investigated on mRNA transcript of the catalase gene (cat) and CAT activity in zebrafish. We determined tissue-specific distribution of zebrafish cat and bioinformatics analysis. Muscle, liver, intestine, heart, kidney, brain, eye, gills, swim bladder, skin, ovary and testis tissue samples from three female and three male fish were dissected to detect tissue-spesific distrubition while liver and gill tissues were dissected to evaluate the effect of acute stress in zebrafish. The steady-state level of zebrafish cat transcript in gill (۳۱۱±۱۱.۳۲) was lower than liver (۵۹۵.۵۳±۱۴.۴۱) but higher than muscle (۱۳۲.۸۹±۹.۲۱), testis (۱۲۰.۰۳±۶.۹۹), kidney (۱۱۸.۹۶±۸.۸۷), ovary (۱۰۴.۳۱±۸.۲۲), intestine (۳۷.۲۸±۳.۱۱), brain (۱۹.۱۷±۲.۰۱), eye (۱۸.۳۰±۲.۱۰), heart (۱۵.۷۹±۲.۰۱), spleen (۷.۷±۰.۹۱), swim bladder (۶.۹۷±۰.۲۱), and skin (۴.۵۹±۰.۳۱). Expression of cat was significantly decreased in liver and gill tissues after exposure to two concentrations of paraquat (p< ۰.۰۵). Measurement of enzyme activities in zebrafish, exposed to ۰.۳۰ and ۰.۱۵ ppm of paraquat for ۷۲ h duration, showed significant (p< ۰.۰۵) variations in CAT activity compared to that of the control. Different steady-state levels among tissues in zebrafish could be explained by duplicated genes in teleost fish that arose through teleost specific-whole genome duplication exhibiting a dissimilar tissue distribution.کلیدواژه ها
Bioinformatics, Gene expression, Enzyme activity, Catalase, Zebrafishاطلاعات بیشتر در مورد COI
COI مخفف عبارت CIVILICA Object Identifier به معنی شناسه سیویلیکا برای اسناد است. COI کدی است که مطابق محل انتشار، به مقالات کنفرانسها و ژورنالهای داخل کشور به هنگام نمایه سازی بر روی پایگاه استنادی سیویلیکا اختصاص می یابد.
کد COI به مفهوم کد ملی اسناد نمایه شده در سیویلیکا است و کدی یکتا و ثابت است و به همین دلیل همواره قابلیت استناد و پیگیری دارد.